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采用毛细管电泳安培法建立了肉苁蓉中松果菊苷含量的检测方法，探讨了缓冲溶液种类、工作电位、分离电压、进样时间等对分离和检测的影响。在15mmol／L硼砂缓冲溶液（pH9．5），25kV电压，0．6V工作电位的条件下，松果菊苷的质量浓度在0．5—50．0mg／L范围内与峰面积呈良好线性，相关系数为0．9994，检出限（S／N=3）为0．1mg／L，回收率为98％-102％。该法简便、快速、准确，可用于肉苁蓉中松果菊苷的质量控制。