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随着下一代基因测序技术的发展,其数据处理面临着越来越高的要求和挑战,基因测序软件厂商的基本数据处理程序已经不能满足实验要求。为此,提出一种新的数据处理方法(NRDPT)。在第3代基因测序原理的基础上,根据边缘信息和霍夫变换重新设计图像的处理步骤,给出新的基因簇定位算法,并设计两步配准算法。实验结果表明,与传统的直接配准方法相比,该方法能使配准速度提升约9倍。