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利用7对AFLP引物组合检测了中国对虾连续五代选育群体基因组DNA的遗传结构，根据AFLP分析结果计算了选育世代群体间的遗传相似系数和遗传距离。结果表明，AFLP标记表现出较高的多态检测效率,7对引物共产生500余条带,平均每对引物组合检测到33.7个多态性标记,平均杂合度为0.0854～0.1025,非常适合于遗传多样性分析。结果显示，随着选育世代的增加，选育群体的遗传多样性呈现下降趋势，但随着选育时间的延长，群体之间的分化逐渐降低，群体的遗传结构开始趋于稳定，成为一个品系。