背景：补肾健脾活血方是临床常用于治疗骨质疏松症的经验用方，但其潜在的分子作用机制尚需深入探讨。目的：通过网络药理学方法探讨补肾健脾活血方治疗骨质疏松症的潜在分子机制，并初步验证其通过组蛋白甲基化修饰发挥作用的可能性。方法：通过网络药理学的方法，利用相关数据库及软件筛选出补肾健脾活血方的活性药物成分及作用靶点，获取骨质疏松症相关疾病靶点，取交集得到补肾健脾活血方治疗骨质疏松症的潜在作用靶点。使用String和Cytoscape软件构建药物成分-靶点网络，筛选出核心作用靶点。于GO生物学分析结果提取组蛋白修饰相关功能及相关基因，从核心作用靶点中找到与组蛋白修饰相关靶点基因。结合文献分析靶点基因在骨质疏松症与组蛋白修饰中可能发挥的生物学作用，采用体外细胞实验验证补肾健脾活血方影响与靶点密切相关的组蛋白去甲基化酶JMJD2B在骨质疏松症中可能发挥的促成骨分化作用。结果与结论：（1）共筛选出补肾健脾活血方治疗骨质疏松症相关活性药物成分118个，对应靶点165个，核心靶点为IL6、TP53、FOS、JUN、STAT3、RELA、CCND1、MYC、MAPK1、MAPK8、MAPK14、VEGFA、AKT1、ESR1、TNF、NR3C1等；（2）GO生物学功能分析得出，对药物的反应、对营养水平的反应、对氧化应激的反应、对类固醇激素的反应、转录调节、转录因子结合、磷酸酶结合、蛋白酶结合、类固醇激素受体活性等生物学功能与共同靶点密切相关；（3）MAPK8、VEGFA和TP53等核心靶点与组蛋白修饰功能有关，木犀草素、槲皮素和山奈酚等可能是影响组蛋白修饰功能治疗骨质疏松症的主要药物成分；（4）体外细胞实验结果表明，补肾健脾活血方含药血清干预下大鼠骨髓间充质干细胞的成骨相关碱性磷酸酶和JMJD2B、RUNX2蛋白表达均升高（P <0.05）；（5）与补肾健脾活血方网络药理学靶点密切相关的组蛋白去甲基化酶JMJD2B可能发挥着促成骨分化作用以治疗骨质疏松症。