为防止新收获的油菜籽变质、降低出油率，可采取以下方法进行处理。
　　1.及时整晒油菜籽脱粒前，应先把油菜秸晒1遍，脱粒后再抢晴暴晒。晒时要薄摊勤翻，以防籽粒吸热散湿不匀、入库后引起变质。当油菜籽晒至含水量达8%时即可。切忌在柏油路上铺晒油菜籽，以免被污染。检验其含水量是否达到安全贮存标准的方法为：抓1把油菜籽平摊在桌面上，用瓦片重压，如有脆声表明达到安全贮存标准。
　　2.清除杂质种子中的杂物多，不仅降低种子品质和出油率，同时也会导致种子堆内发热发霉如泥团、土、碎枝、残壳等，吸水力强，携带病菌，特别在高温条件下，极易引起种子发热发霉，病粒、不熟种子、碎籽不仅比正常的种子呼吸能力强，耗氧多，同时暴露的籽粒又是微生物繁殖的好场所，因此，暴晒过的油菜籽，还要进行清理，通过风扬、筛等办法清除泥沙等杂质。净度鉴别方法是：随手抓1把油菜籽，掌心向上，手指并拢，然后将手倾斜抖动，让油菜籽徐徐下落，如掌心只留下少量灰土，即表明杂质含量符合要求。
　　3.密闭保管油菜籽收下来，如遇阴雨天气不能出晒，可采取以下4种救急措施，以防霉变。①拌盐法。将盐拌入新收获的菜籽中可以降低水分，抑制酶的活动，使脂肪不易分解。每100克油菜籽里拌1克食盐，能在5—6天内维持它贮藏的稳定性，出油率仍能保持原来的95%。②密闭法。新收获的油菜籽，如遇阴雨天不能晒时，可将油菜籽装入围囤内，然后用塑料薄膜覆盖，周围地上用泥土压实密封不透气，形成了自然缺氧的环境。用这种方法处理高水分的菜籽，虽然品质稍有降低，但是可以使菜籽在7～10天内不生芽、不发热、不霉烂，必要时还可在密封菜籽堆内施放低剂量磷化铝片实施化学贮藏。此法能赢得时间，待天晴后，再抓紧时间暴晒。③摊晾法。将菜籽铺在晾晒器具上，放在通风的地方。摊菜籽时，既要薄，又要匀，并且每隔1小时翻动1次。④烘干法。有条件的地方可用烘干机烘干。但通入的热风温度不能超过80℃，否则，就会影响菜籽质量。