目的探讨荧光定量PCR技术在疟疾诊断中的临床应用价值。方法收集本院2010年1月至2012年3月疑似疟疾患者的血样共67份和健康人血样20份,采用荧光定量PCR法进行疟原虫检测,并与镜检法和胶体金免疫层析法的敏感性和特异性进行对比分析。对临床确诊的20例疟疾患者在抗疟药治疗前后的虫体密度与3种方法检测的疟原虫结果进行对比分析。结果 67份患者血样用荧光定量PCR法、镜检法和胶体金免疫层析法检测的疟原虫阳性率,分别为62.7%、56.7%和52.2%,差异无统计学意义(P=0.471)。3种方法检测20份健康人血样结果均为疟原虫阴性,特异性为100%。荧光定量PCR检测结果与镜检虫体密度呈直线相关(r=0.958,P=0.042)。原虫血症较高水平时3种方法的检测结果差异无统计学意义(P>0.05);在药物治疗后原虫血症较低水平时,虫体密度<50/μl时,镜检法与胶体金免疫层析法检测结果均为阴性,而荧光定量PCR法检测仍为阳性,总疟原虫拷贝数均值为2.92×102拷贝/ml,提示荧光定量PCR检测方法的敏感性高于镜检法和和胶体金免疫层析法。结论荧光定量PCR方法检测疟原虫快速敏感,且特异性强,可作为镜检法的补充。