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目的构建蛋白质三维结构的统一坐标系。方法利用蛋白质原子的质量作为权重，根据每个原子的位置信息求出蛋白质的质心，以此作为统一坐标系的坐标原点；再利用蛋白质位置坐标的二阶矩构造的矩阵求出蛋白质主成分的坐标向量，作为蛋白质三维坐标的基轴。结果编程实现了蛋白质统一坐标系的建立。结论该方法有效可行，为后续的蛋白质结构研究奠定基础。