目的:对南京市社区卫生服务实行药房托管前后经济运行的相关数据作深入分析,探寻"南京模式"的实施效果及存在的问题,为政府提供政策建议。方法:对南京市2004～2008年卫生服务中心的经济运行数据利用Ex-cel2007和SPSS16.0进行方差分析和两两比较,比较药房托管前后卫生服务中心总收支和药品收支的变化。结果:5年间总收支结余率平均为1.7%,药品收支结余率平均为19.8%,医疗收支结余率平均为-54.76%。2004年、2005年、2006年药品收支结余率无差别,2004年、2005年与2008年药品收支结余率有差别,2006年与2007年、2008年的药品收支结余率也有差别,2007年、2008年没有统计学意义。结论:政府应增加对社区卫生服务机构的投入,加强对社区卫生机构的收支两条线管理,完善药品流通体系,推行国家基本药物制度,社区用药全部实行基本用药零差率销售。