【摘 要】
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为了揭示烟草不同器官中内生细菌的分布规律，应用Illumina测序平台的MiSeq高通量测序仪对烟草根、茎、叶中内生细菌的16SrDNA—V4区扩增子进行测序，对测得数据进行生物信息学分
【机 构】
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昆明学院,云南省高校生物炭工程研究中心
【基金项目】
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国家自然科学基金(编号:41361056);云南省教育厅科学研究项目(编号:2016ZDX096、2014Y390);昆明学院“人才引进”项目(编号:YJL14005);云南省高校优势特色重点学科(生态学)建设项目(编号:05000511311);云南省特色生物资源开发与利用重点实验室开放基金(编号:GXKJ201621)
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为了揭示烟草不同器官中内生细菌的分布规律，应用Illumina测序平台的MiSeq高通量测序仪对烟草根、茎、叶中内生细菌的16SrDNA—V4区扩增子进行测序，对测得数据进行生物信息学分析，评价物种O／多样性和口多样性。经FLASH软件对序列进行拼接，茎、叶、根样品分别获得36129、60312、52573条原始序列，经Qiime软件过滤，再剔除宿主的叶绿体和线粒体序列，最终分别得到35190、58938、51268条有效序列，在97％的序列相似性水平上，这些有效序列被Uparse软件划分为1447、11
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