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我国合浦珠母贝Pinctada fucata的命名较混乱，与日本的P．fucata martensii和澳大利亚的P.imbricata的分类关系存在争议。用ITSs序列和AFLP标记对这3个种的遗传关系进行了分析。结果表明这3个地理种的遗传分化很低，种内和种间的遗传距离相互重叠，AFLP数据的聚类分析表明澳大利亚种群大部分个体单独聚合成一支，主成分分析结果相似。种间的遗传距离与分化程度与其地理距离呈正相关。分子方差结果也表明种间的差异较小，低于6％。这些结果表明这3个种实际上是同一物种。由于大西洋的P.