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目的本研究旨在通过对贾第鞭毛虫和隐孢子虫（简称“两虫”）进行序列信息分析的基础上，利用焦磷酸测序技术建立一种快速、简单地确证两虫的方法。方法通过序列信息比对，对贾第鞭毛虫的磷酸丙糖异构酶（triose phosphate isomerase，tim）基因和隐孢子虫18SrRNA基因的保守区段设计扩增引物及测序引物。用Sheather’S蔗糖密度离心法从粪便标本中分离纯化贾第鞭毛虫孢囊和隐孢子虫卯囊。酚一氯仿法抽提孢囊、卯囊总DNA，PCR扩增目的基因片段，采用焦磷酸测序技术（Pyrosequencing