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[学位论文] 作者：左光宏,
来源：复旦大学 年份：2010
蛋白质是生命活动的基本单元。活体细胞的每一项功能的实现都离不开蛋白质。而蛋白质的这些丰富功能基本上由其结构决定。对于蛋白质结构的研究，能极大的促进我们对于生物细胞......
[会议论文] 作者：左光宏,
来源：第八届海峡两岸生物学启发的理论科学问题研讨会(BITS8) 年份：2012
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[期刊论文] 作者：左光宏,,
来源：科研信息化技术与应用 年份：2011
分子动力学方法是基于分子力场,通过数值求解牛顿动力学方程来模拟原子与分子运动的计算机模拟方法。利用分子动力学能模拟分子系统与时间相关演化轨迹,研究分子系统的热力学...
[期刊论文] 作者：寇大治,左光宏,,
来源：计算机应用与软件 年份：2014
在分子动力学并行计算的过程中,正确地处理好并行规模与PME(Particle-Mesh Ewald)方法的任务分配,对于提高分子动力学的并行效率具有非常重要的影响。以常用的分子动力学软件Gromacs[1-3]为例,利用上海超级计算中心"魔方"超级计算平台,就不同并行规模与不同PME......
[期刊论文] 作者：左光宏,郝柏林,
来源：生物技术通报 年份：2015
组分矢量构树（CVTree）方法是基于全基因组的、不用序列联配的物种亲缘关系研究方法。CVTree3是我们最新开发的CVTree网络服务器,它基于并行化的核心程序,以适应当前基因组数据...
[会议论文] 作者：郝柏林,左光宏,
来源：第七届全国生物信息学与系统生物学学术大会 年份：2016
原核生物分类研究一向针对具体物种,很少涉及整体性和大范围问题.然而,现在客观条件发生了变化.第一,《原核生物第Ⅳ版》(The Prokaryotes Ⅳ,2013-2014)和《伯杰古菌和...
[会议论文] 作者：左光宏,郝柏林,
来源：第十一届全国软物质与生命物质物理学术会议 年份：2018
CVTree 方法是郝柏林院士于2004 年提出的原核生物亲缘关系与分类研究方法.它基于全基因组且无需序列比对,能高效准确的处理大量物种的进化与亲缘关系.近些年来,我们致力...
[期刊论文] 作者：左光宏,郝柏林,,
来源：中国科学:生命科学 年份：2017
微生物基因组和RNA序列构成生物学数据的重要部分.从基因组出发而且不用序列联配的CVTree和基于16S rRNA序列联配的LVTree,是两套原始数据和计算过程相互独立的构建原核生物亲缘树和分类系统的途径.这两套途径的自动化,使亲缘关系和分类系统成为大数据分析的副......
[期刊论文] 作者：李强,左光宏,郝柏林,,
来源：中国科学:物理学 力学 天文学 年份：2014
我们课题组近10年所发展的组分矢量(CVTree)方法,已经成为从完全基因组出发而不使用序列联配来构建细菌亲缘关系的有效手段.在整个生物分类学日益后继乏人的背景下,组分矢量(CVTree)方法伴随着基因组时代的发展,成为人人可以方便使用的微生物分类的定义性工具.......
[会议论文] 作者：左光宏,徐昭,郝柏林,
来源：第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会 年份：2014
确认古菌构成三个生命超界之一，是16S rRNA序列分析的重大成果。目前基于16SrRNA序列的大树上有366个古菌，而基于全基因组的CVTree上有165个古菌。它们的分类学覆盖已经相...
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