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[期刊论文] 作者:曹宗雁,, 来源:科研信息化技术与应用 年份:2004
ue*M#’#dkB4##8#”专利申请号:00109“7公开号:1278062申请日:00.06.23公开日:00.12.27申请人地址:(100084川C京市海淀区清华园申请人:清华大学发明人:隋森芳文摘:本发明属于生物技...
[学位论文] 作者:曹宗雁, 来源:中国科学院研究生院 中国科学院大学 年份:2010
高性能计算机的飞速发展使得系统管理工作变得尤为重要。要利用高性能计算机强大的计算能力,就必须通过有效的系统管理使其能够稳定的提供服务。作为院三层超算环境的建设单位......
[会议论文] 作者:Cao Zongyan,曹宗雁, 来源:首届中国科学院超级计算应用大会(SCA2011) 年份:2011
  本文关注如何在高性能计算集群上提供良好的运行时环境的问题,以使得并行应用程序获得更高的性能。指出了高性能计算集群运行过程中运行时环境配置优化需要考虑到的内容,包......
[期刊论文] 作者:牛铁,朱鹏,赵毅,曹宗雁,, 来源:计算机应用 年份:2010
在超级计算环境中,为避免计算资源滥用,确保每个用户有机会利用超级计算机求解生产、科研中的复杂问题,产出更多成果,在定期采集、解析作业日志的基础上,通过LSF API、shell编程,设计和实现了一套计算配额系统,用于对用户计算资源的配额、限制及使用情况统计分......
[期刊论文] 作者:孟晨,曹宗雁,王龙,迟学斌,, 来源:计算机工程与应用 年份:2016
容错问题是大规模并行程序长时间运行中不可回避的问题,超级计算机中异构计算部件的加入使得该问题更加复杂。考察由CPU和GPU组成的异构并行系统中应用程序的容错,利用Charm++...
[会议论文] 作者:孟晨,曹宗雁,王龙,迟学斌, 来源:2013全国高性能计算学术年会 年份:2013
目前容错问题已成为大规模并行程序长时间运行中不可回避的问题.本文针对由CPU和GPU组成的异构并行系统中的硬件故障问题,面向大规模的计算宇宙学应用,利用Charm++并行平台提出并实现了一种有效的应用容错机制.并通过实验和分析,验证了算法的高效性和可行性,不......
[期刊论文] 作者:曹宗雁,郎显宇,刘昕,迟学斌,, 来源:计算机应用 年份:2011
针对生物信息学研究中的超大规模序列比对计算问题进行了研究,解决了现有的e-PCR软件包在处理小麦基因引物扩增比对任务中存在的内存瓶颈、I/O瓶颈和计算时间瓶颈问题,利用数据和任务分割的基本方法,使其最关键的引物与模板的比对计算能够大规模并行,进而采用基......
[期刊论文] 作者:曹荣强,曹宗雁,迟学斌,肖海力,, 来源:计算机应用 年份:2010
根据高性能计算和网格的特点,提出一种网格二次开发模型(GRM)。结合RMI和SSL/TLS技术,该模型提供了访问中间件的一致性接口,屏蔽了通过网络访问网格的繁杂问题,解决了敏感数据在不安全的广域网中传输的问题。以科学计算网格的中间件为基础,实现了GRM。多个基于G......
[期刊论文] 作者:贾伟乐,曹宗雁,付继芸,王龙,, 来源:科研信息化技术与应用 年份:2012
平面波赝势密度泛函方法是材料科学计算中最常用的方法,但是其CPU代码计算时间长并且扩展性差,限制了其在超级计算机上的绝对速度。本文综述了使用图形处理器加速第一性原理计算软件的发展,讨论了VASP(Vienna Ab-initio Simulation Package),Quantum Espresso,P......
[期刊论文] 作者:赵毅,朱鹏,迟学斌,牛铁,曹宗雁,, 来源:计算机研究与发展 年份:2007
高性能计算应用在高性能计算技术的支持下为科技创新做出了巨大贡献,并且和高性能计算技术在相辅相成中不断发展.自2004年以来,中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心针...
[期刊论文] 作者:曹宗雁,牛铁,赵毅,朱鹏,迟学斌,, 来源:计算机应用研究 年份:2011
针对如何缓解Infiniband集群中因通信冲突引起的MPI程序性能下降问题进行了研究,从系统管理的角度出发,提出了通过改变进程映射来优化MPI作业加载方案从而优化应用程序通信性能的方法,设计了用于评价MPI作业加载方案的通信性能损失系数(CPLR)指标,基于模拟退火......
[会议论文] 作者:曹宗雁,赵毅,牛铁,朱鹏,迟学斌,, 来源:华中科技大学学报(自然科学版) 年份:2011
从超级计算中心建设和服务的实际需求出发,设计并实现了基于用户评价的集群作业优先级调度策略,从而为科学研究计算提供更多有效机时.从用户基本属性、行为特征以及用户作业...
[期刊论文] 作者:曹宗雁,曹荣强,戴志辉,朱鹏,迟学斌,, 来源:计算机应用研究 年份:2011
对高性能计算集群在运行过程中如何通过关闭闲置节点来实现有效节能的问题进行了研究和探讨,设计和实现了基于任务负载量统计监测的节点启停机制。根据对系统中作业运行和排队情况的记录和分析,通过参数估计设计了反映队列任务情况的负载因子,并围绕负载因子制......
[期刊论文] 作者:孟晨,曹宗雁,王龙,迟学斌2016年4月15日, 来源:中国新时代 年份:2020
[期刊论文] 作者:戴志辉,肖海力,曹荣强,迟学斌,曹宗雁,, 来源:计算机应用研究 年份:2011
为确保建成的中国科学院"十一五"信息化重大专项超级计算环境提供稳定可靠的服务,提出三层架构超级计算环境的容错框架。对计算环境可靠性和计算节点可靠性两大部分,通过作业可靠性、服务可靠性和网格节点可靠性三个主要方面的可靠性研究,提出并实现了三层架构......
[期刊论文] 作者:曹宗雁,郎显宇,刘昕,迟学斌,CAOZong-yan,LANGXian-yu,LIUXin,CHIXue-bin, 来源:计算机应用 年份:2011
[期刊论文] 作者:贾伟乐, 曹宗雁, 王龙, 迟学斌, 高卫国, 汪林望,, 来源:计算机科学与探索 年份:2014
基于平面波的第一原理计算方法是目前材料科学中最常用的方法,但传统的CPU并行计算遇到可扩展性瓶颈,无法改善其求解的绝对速度。系统地介绍了利用图形处理器(graphic proces...
[期刊论文] 作者:付继芸,贾伟乐,曹宗雁,王龙,叶煌,迟学斌,, 来源:计算机应用 年份:2013
平面波赝势密度泛函(PWP-DFT)计算是材料计算中应用最广泛的方法,其中映射计算是PWP-DFT方法求解自洽迭代中重要的一部分。针对映射势能计算成为软件加速的瓶颈,提出了针对该部分的图形处理器(GPU)加速算法,其中考虑GPU的特点:1)使用了新的并行机制求解非局部映......
[期刊论文] 作者:曹宗雁,赵毅,牛铁,朱鹏,迟学斌,CaoZongyan,ZhaoYi,NiuTie,ZhuPeng,ChiXuebin, 来源:黑龙江科技信息 年份:2011
本文通过对荣华二采区10...
[会议论文] 作者:Niu Tie,牛铁,Zhu Peng,朱鹏,Cao Zongyan,曹宗雁,Liu Fei,刘飞, 来源:首届中国科学院超级计算应用大会(SCA2011) 年份:2011
  由于具有很高的计算能力和存储空间,超级计算集群是攻击者眼中具有吸引力的目标,安全形势不容乐观。本文从超级计算集群的特点出发,分析了它可能面临的安全风险,结合运行经验......
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