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[学位论文] 作者:顾倜,, 来源:苏州大学 年份:2017
RNA在表达蛋白质的遗传信息中起重要作用。为了了解RNA如何执行它们的功能,我们需要知道它们的结构。假结是RNA中一种重要的二级结构,由于建模的困难导致它更难被预测。本文...
[期刊论文] 作者:顾倜,蔡磊鑫,王帅,吕强, 来源:生物信息学 年份:2017
假结是RNA中一种重要的结构,由于建模的困难导致它更难被预测。通过碱基之间的配对概率来预测含假结RNA二级结构的ProbKnot算法具有很高的精度,但该算法仅用了配对概率作为预测...
[期刊论文] 作者:王帅,蔡磊鑫,顾倜,吕强,, 来源:计算机应用与软件 年份:2017
RNA二级结构的打分函数在RNA二级结构预测中扮演着越来越重要的角色。目前对RNA二级结构的打分函数并没有很好地抓住RNA的折叠机制。我们认为递归神经网络层与层之间的信息传递方式和RNA的折叠方式有相似之处。提出使用双向LSTM(Long Short term Memory)神经网......
[期刊论文] 作者:蔡磊鑫,顾倜,王帅,吕强,, 来源:小型微型计算机系统 年份:2017
RNA是生物遗传信息的中间载体,在基因编码、解码、调控和表达等方面具有重要作用.RNA二级结构预测是理解RNA生化功能的主要途径.假结是最广泛的RNA结构单元.带假结的RNA二级...
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