栗背短脚鹎为鹎科的中小型鸟类,主要分布在中国长江以南,国外仅见于越南北部.其分类地位一直有争议,部分学者则认为该种包括两个亚种即指名亚种和华南亚种.而另一部分学者认为本种与灰短脚鹎仅为同种的不同色型而将其归为H.flavala的两个亚种.此外,郑作新认为本种为单型种,无亚种分化,H.canipennis为H.flavala的亚种.本研究通过线粒体ND2基因对这个类群进行遗传分析,以期初步澄清栗背短脚鹎的分类地位.结合来自GenBank的1条序列,本研究对包括11个采样点的66号栗背短脚鹎标本的87条ND2全序列进行遗传分析.研究结果表明栗背短脚鹎由两个互为单系群的亚种H.c.canipennis与H.c.castanonotus组成,它们与灰短脚鹎云南的两个亚种(H.f.flavala和H.f.bourdellei)组成的分支互为单系群.结合线粒体分子钟估计Hc.canipennis和H.c.casdanonotu:可能的分化时间大约在25万年前，相当于中更新世的第3温暖期，可能由于气候温暖海平面的上涨导致海南岛上的种群与大陆种群形成隔离，而它们与云南的灰短脚鹎的分化大约发生在45万年前，对应于中更新世的第3寒冷期即青藏高原的聂拉木冰期，推测冰期引起栖息地片段化从而造成栗背短脚鹎和云南灰短脚鹎种群的分化，灰短脚鸭版纳种群中个别个体兼具栗背短脚鹎和灰短脚鹎两个谱系的序列变异特征，这在ML树和单倍型网络图上均有体现，暗示这两个谱系可能发生过历史基因流或是曾经共享同一祖先基因库。相关的研究结果将随着形态、生态、行为及遗传数据的丰富进一步证实.