海南三亚斑节对虾野生种群线粒体16S rRNA基因和控制区序列的多态性研究

来源 :国家“863”计划资源环境技术领域第三届海洋生物高技术论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:u20051026
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采用聚合酶链式反应(PCR)技术对海南三亚的斑节对虾(Penaeusmonodon)群体(n=20)的mtDNA16SrRNA基因和控制区序列进行扩增,PCR产物经纯化后进行测序,得到16SrRNA序列495bp的核苷酸片段和控制区序列470bp的核苷酸片段.用Clustal_X排序软件进行16SrRNA和控制区序列的对位排列.通过Mega软件对所得线粒体16SrRNA基因片段和控制区序列进行比较,16SrRNA序列检测出17个,8种单倍型;控制区序列检测出101个碱基存在变异,17种单倍型.运用DNASP软件计算所得该群体16SrRNA序列核苷酸多样性(Pi)和平均核苷酸差异数(K)分别为0.00435和2.137;控制区序列核苷酸多样性(Pi)和平均核苷酸差异数(K)分别为0.04728和20.905.研究结果表明:相对于mtDNA16SrRNA序列分析,采用mtDNA控制区序列分析能更好地反映斑节对虾种群的遗传多样性.
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