证据的合法性主要是程序合法、主体合法和客体合法。表现在法医鉴定证据上，主要是鉴定材料来源的合法，委托受理的合法，鉴定机构的合法，鉴定人员的合法等。鉴定意见是鉴定人根据自己的专业知识给出的专家意见，是客观性与主观性的统一，受鉴定人的主观影响，因此，鉴定人应保持中立，应当遵守法律有关回避的规定。保全法医证据的关联性，就要做好鉴定材料的提取、包装、保存与流转。检材提取方法要正确，包装保存科学规范，符合技术规范要求。鉴定材料的的流转记录有人员和唯一性标识，记录及时，内容真实、客观、准确、完整、清晰，信息充分足够，能够溯源，能证明鉴定材料在鉴定的所有环节不被调包、污染、伪造等。科学性是法医科学证据的内在特性，其准确性、权威性高过其他证据，但法医科学证据同样有其不确定性，其证明力受检验方法的科学性、检查方法的规范性、实验室环境条件、仪器设备的先进性、标准物质或试剂的有效性、实验室人员能力等限制。