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通过同源性比较设计引物，分别扩增羊驼KIT基因exon18～19和intron18，并利用PCR-SSCP技术对我国现有羊驼KIT基因intron18进行多态性分析。结果表明：羊驼KIT基因exon18～19长225 bp，包括54 bp的exon18(全长112 bp)、108 bp的intron18和63 bp的exon19。从测序结果看，intron18与exon18和exon19交际处有GT-AG规则，符合分子遗传学的理论。而用另一引物扩增不同毛色羊驼Intron18所得的核苷酸序列与exon18～exon19中测得的intron18序列完全相同，未发现"AGTT/TGGA/TTAG"缺失突变现象和核苷酸片段大小差异，即不存在多态性。
因此推测在同一品种内。KIT基因对毛色影响的原因不一定是由于KIT基因intron18缺失4个碱基导致KIT基因表达失调而致。