关于熨烫疗法的治疗机理，《中医熨疗法大全》、《中国熨法》、《敷熨治百病》等书籍进行了比较全面的总结:主要还是调整脏腑经络气血和吴师机“外治之理即内治之理”的理论。如《中医熨疗法大全》指出，熨烫疗法首先是对经络的皮部和穴位产生刺激，从而理论上推论依靠“皮部/穴位-络脉-经脉-脏腑”的关系，将治疗的信息由表向里传达，最后调整脏腑和气血的平衡。而对于吴师机的外治理论，主要针对中药药物的皮肤给药途径，认为利用熨烫的温热效应，促进局部血液循环，加快药物的扩散和吸收，达到治疗局部疾病的作用。现代研究有所发展，但始终没有走出温热效应“局部作用”的框架，即消除局部严重，解除局部肌肉痉挛等，最后缓解疼痛改善运动系统功能。据人们前期临床初步观察统计，最佳的熨烫治疗温度在45℃，这也合乎李亮等人的有关研究发现。因为延髓背侧网状亚核神经元被认为是“脊髓-网状结构-丘脑”间的信息网络，是重要的传递温热感觉信号的传导和调节通路。随着熨烫温度时间的延长，该神经处元的反应随之增大，至于其治疗作用成何等对应关系尚需进一步研究。熨烫疗法局部的温热效应已经众所周知，然而不过是表象，其作用的内在机制是从整体层面通过交互网络调节人体内环境。事实上，人们对经络经穴新的认识和诊释决定着人们对熨烫疗法理解认识的深度。