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武汉市跨扬子准地台和秦岭地槽，经历喜山、印支及新构造运动，断层和褶皱发育，岩石地层沉积相变较大，可界定为复杂基岩地层区。结合在武汉市复杂基岩地层区开展的三维地质建模工作，提出复杂地质体建模需要注意断层、地层尖灭、基岩零星出露处理及复杂空间数据模型表达方法几个要点，为复杂地层区三维地质建模工作提供借鉴。