一串红的转录组测序与分析

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  一串红为唇型科鼠尾草属多年生草本花卉,原产于南美洲热带地区,常作1、2年生栽培。其花序修长,总状花序开花不断,花期较长,观赏价值高,广泛用作花丛、花坛、组合盆栽,也用于花境与林缘小道的镶边。通过几十年的育种积累,我们拥有了300多份一串红品系资源。为了能够深入挖掘一串红优良性状的遗传特性,我们选取野生型35与其突变型彩铃虹为材料,各混合同一生长阶段的10株的根、茎和叶片,提取RNA,利用Illumina Cluster Station和Illumina Genome Analyzer系统进行转录组测序,通过比对、拼接和组装,获得含49 310个基因片段的一串红转录组序列库。
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