阵列比较基因组杂交检测和分析-原发性闭经患者的全基因组拷贝数变化

来源 :中华医学第九次全国检验医学学术会议暨中国医院协会临床检验管理专业委员会第六届全国临床检验实验室管理学术会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xjl982050
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  目的:检测和分析1例患有原发性闭经伴高雄激素血症患者的全基因组拷贝数变化(copynumber variations,CNVs),探讨微阵列比较基因组杂交(array-based comparativegenomic hybridization,array-CGH)在分子细胞遗传诊断中应用的可行性和优越性。
  方法:病例资料:女,19岁,身高153 cm,43kg,体重指数18.4 kg/m2。表现为原发性闭经,轻微的上唇和乳晕周多毛,痔疮,乳房发育差。超声检测均提示始基子宫,双侧附件区、肾脏、输尿管、膀胱和肾上腺未见异常。激素检测显示睾酮水平升高。研究方法:应用G显带染色体分析技术对患者进行常规核型分析,array-CGH芯片对患者进行全基因组高分辨率扫描和分析,实时定量PCR (real-time quantitative PCR, RT-qPCR)验证array-CGH芯片检测结果的准确性。
  结果:常规G显带染色体分析显示患者的核型无异常。Array-CGH芯片检测发现患者存在22个亚显微CNVs,其中8个CNVs与国际良性CNVs数据库Database of Genomic Variants中的CNVs相重叠,可能是良性CNVs;剩余14个CNVs与Database of Genomic Variants及国际病理性CNVs数据库DECIPHER中的CNVs均有重叠,被认为是性质小明的CNVs。通过基因功能分析发现,14个性质不明的CNVs中的13个CNVs并不含有与原发性闭经及高雄激素血症相关的基因;剩余的1个CNVs,即del (4) (q13.2)(70183990-70264889),含有UGT2828基因。此基因编码的蛋白属于尿苷二磷酸葡萄糖苷酸基转移酶(Uridinediphospho-glucuronosyl transferase, UGT)家族。UGT能够催化内源性和外源性疏水分子转化成葡萄糖醛酸苷衍生物,在类同醇激素的功能和代谢方面起着至关重要的作用。UGT2828蛋白分为三型:Ⅰ型和Ⅱ型UGT2828蛋白共表达于肝脏、乳腺和LNCaP细胞系,Ⅲ型UGT2828蛋白分布于人类大多数外周组织。Ⅰ型UGT2828蛋白与C19和C18类固醇激素如睾酮、雄酮、雌二醇等都能结合,与类固醇激素的功能和代谢密切相关。一方面,Ⅰ型UGT2828蛋白表达于核周膜,在类固醇激素入核之前,通过与类固醇激素结合,调节类固醇激素与受体的结合率,影响激素反应。另一方面,肝脏中的I型UGT2828蛋白有利于清除血液循环中的类固醇激素,乳腺组织中I型UGT2828蛋白涉及雄激素和雌激素的失活。UGT2828基因的缺失可能与原发性闭经等异常表型相关,可能的机制如下:UGT2828基因的缺失导致睾酮葡萄昔酸化减少以及清除减少,睾酮水平升高。高睾酮血症可引起女性雄性化,如脸部多毛、痤疮、乳房发育差,并可能导致米勒管发育不良,形成始基子宫,出现原发性闭经。
  结论:UGT2828基因的缺失可能与高雄激素血症及原发性闭经相关。与传统的细胞遗传分析方法相比,array-CGH具有高分辨率、高通量和高准确性等优点,有利于致病基因的发掘。
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