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以聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)所反映的4个环境样品细菌群落相似性关系为参照，比较了BIOLOG GN2、GP2、ECO微孔板所反映的细菌群落相似性关系，并考察了超低温冻存预处理技术对细菌群落BIOLOG分析结果的影响。结果表明：3种微孔板所反映的细菌群落特征聚类分析结果完全不同，并且完全不同于PCR-DGGE分析所反映的群落相似性特征；超低温冻存预处理并不显著影响ECO板分析结果以及其它微孔板所反映的丰富度指数值(P>0.05)，可以将其作为BIOLOGECO微孔板分析的样品保存手段。