复合抗菌肽对高精料育肥成都麻羊瘤胃菌群结构及部分功能菌数量的影响

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bianyitijie
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瘤胃微生物系统的平衡是维持瘤胃正常功能的重要保障。在减抗禁抗时代,抗菌肽等具有广泛生物功能的抗生素替代物越来越受到业内外的青睐。本文运用高通量测序技术分析比较高精肥育山羊添加复合抗菌肽(AMPs)或瘤胃素后瘤胃细菌多样性及群落结构差异,并利用q RT-PCR技术分析比较瘤胃内部分功能菌数量差异,旨在探究复合抗菌肽对高精肥育山羊瘤胃菌群的影响,为复合抗菌肽的开发利用提供理论依据。试验选取25只健康、体重相近(23.69±0.42 kg)的6月龄雄性去势成都麻羊随机分为5组。Ⅰ组(正常对照组)在试验期间均饲喂精粗比40:60全混合日粮,Ⅱ组(高精对照组)、Ⅲ组(抗菌肽组)、Ⅳ组(瘤胃素组)、Ⅴ组(混合组)山羊试验期间分3阶段饲喂,每阶段20d,精粗比依次为60:40、70:30、80:20,Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ各组分别添加抗菌肽2 g·d-1·goat-1、瘤胃素50mg·kg-1·d-1、抗菌肽2 g·d-1·goat-1+瘤胃素50 mg·kg-1·d-1。于试验期第0 d、20 d、40 d和60 d晨饲前每组随机选取3头羊采集瘤胃液(样本组别用A~E表示,4个时间点用1~4表示)。提取瘤胃细菌总DNA,扩增16S r DNA V3-V4区,扩增产物通过Mi Seq平台测序,并通过q RT-PCR测定比较部分功能菌数量变化。试验结果:(1)高精料可降低肥育山羊瘤胃细菌物种丰富度;添加复合抗菌肽或瘤胃素均可提升高精肥育山羊Chao1指数和ACE指数,增加瘤胃细菌物种丰富度,且在40 d(即精粗比70:30)时与Ⅱ、Ⅳ组具有显著差异(P<0.05),但Shannon指数和Simpson指数无显著差异(P>0.05)。(2)所有样品中拟杆菌门相对丰度最高(占总序列40.13%~66.00%),其次为厚壁菌门(22.31%~49.41%)。普雷沃氏菌属为所有样品的优势菌属(27.11%~50.94%)。(3)门水平上,Ⅱ组相对于Ⅰ组降低了拟杆菌门的相对丰度,增加了厚壁菌门的相对丰度,表明高精料可降低瘤胃拟杆菌门相对丰度,增加厚壁菌门相对丰度。Ⅲ组较Ⅱ组、Ⅳ组和Ⅴ组拟杆菌门、变形菌门相对含量增高,厚壁菌门、放线菌门、广古菌门等的相对含量降低,表明添加复合抗菌肽后可增加高精肥育山羊瘤胃拟杆菌门、变形菌门相对丰度,降低厚壁菌门、放线菌门、广古菌门相对丰度,且效果优于添加瘤胃素和混合添加。在属水平上,Ⅱ组相对于Ⅰ组普雷沃氏菌属相对含量更低,长绳菌属、密螺旋体属相对含量更高。Ⅲ组较Ⅱ组增加了普雷沃氏菌属、瘤胃球菌属的相对含量,降低长绳菌属和密螺旋体属的相对含量,且较Ⅳ组和Ⅴ组幅度更大,说明高精料降低了瘤胃普雷沃氏菌属相对丰度,增加长绳菌属、密螺旋体属相对丰度,添加复合抗菌肽可增加高精肥育山羊普雷沃氏菌属、瘤胃球菌属相对丰度,且效果优于添加瘤胃素和混合添加。(4)Ⅱ组相对于Ⅰ组在40 d、60 d时增加了产琥珀酸丝状杆菌、脂解厌氧弧菌、牛链球菌、乳酸杆菌和埃氏巨型球菌数量。表明高精料可增加上述5种菌数量。Ⅲ组较Ⅱ组可在40 d、60 d增加瘤胃产琥珀酸丝状杆菌、溶纤维丁酸弧菌数量,极显著降低乳酸杆菌数量(P<0.01),在60 d增加脂解厌氧弧菌、反刍兽新月形单胞菌、埃氏巨型球菌数量。且较Ⅳ组和Ⅴ组幅度更大。表明添加复合抗菌肽在精粗比70:30和80:20时可增加瘤胃产琥珀酸丝状杆菌、溶纤维丁酸弧菌数量,降低乳酸杆菌数量,在精粗比80:20时可增加脂解厌氧弧菌、反刍兽新月形单胞菌、埃氏巨型球菌数量,且较添加瘤胃素和混合添加效果更佳。结论:成都麻羊瘤胃内丰度最高的菌门为拟杆菌门,最高的菌属为普雷沃氏菌属。高精料饲喂下拟杆菌门、普雷沃氏菌属相对丰度下降、厚壁菌门相对丰度上升。高精料条件下添加复合抗菌肽或瘤胃素可在精粗比70:30时增加瘤胃细菌物种丰富度,增加瘤胃内拟杆菌门、变形菌门相对丰度,增加普雷沃氏菌属、解琥珀酸菌属、瘤胃球菌属和丁酸弧菌属相对丰度,增加瘤胃产琥珀酸丝状杆菌、溶纤维丁酸弧菌、脂解厌氧弧菌、反刍兽新月形单胞菌、埃氏巨型球菌数量,且单独添加复合抗菌肽较添加瘤胃素和混合添加效果更佳。说明复合抗菌肽可调节高精肥育山羊瘤胃菌群结构,促进某些纤维降解菌、蛋白降解菌、淀粉降解菌、脂肪降解菌及乳酸利用菌生长,增强瘤胃对纤维、蛋白质、淀粉、脂肪及乳酸的分解利用,提高山羊生长性能。
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