进入二十一世纪,国内外高校在人才、资金等方面的竞争越来越激烈。由于资源的稀缺性,使得预算管理的重要作用日益凸显出来。通过科学合理的预算,有助于各高校将有限的资源合理地分配至重点扶植学科;也有助于各高校统筹资源,将资源合理分配至各行政部门和各院系,实现资源的统筹规划以及各部门之间的密切联系。另外,高校当前的资金来源中,除了传统的财政拨款外,其他类型的筹资方式也逐渐增多起来。与传统的校级一级预算管理模式相比,校院两级预算管理模式以“统一领导、分级管理”为核心,可以实现财务管理的重心由学校下移到学院,学院除了承担传统的教学任务外,也承担起了更多综合管理的职能。在新的时代背景下,校院两级预算管理模式的优势也逐渐显现出来。论文在对国内外相关文献梳理的基础上,以委托代理理论和新公共管理理论为基础,对QM大学的基本情况和校院两级预算管理模式的基本情况进行阐述,通过对QM大学预算实际执行情况的分析,归纳出QM大学的整体预算与中长期战略偏离、校院两级预算管理协调相对缺乏、院级预算编制参与度较低、校院两级预算控制力度不足和校院两级缺少科学的预算绩效评价体系等五个方面问题。为解决QM大学预算管理中存在的问题,论文从明确QM大学战略目标入手,绘制QM大学的战略地图,构建基于战略导向的校院两级预算管理体系,并从校院两级预算的编制、执行、控制、评价、激励设计了完整的应用程序。最后提出保障以战略为导向的校院两级预算管理运行的措施。