海巡船艇是我国海事部门在海上执法和应急搜救的平台,在海上交通监督管理、海上人命救助、维护国家主权等方面发挥重要的作用,当前海巡船艇正朝大型化、规模化发展,海巡船艇运行成本不断攀升,但是海巡船艇运行成本管理还没有得到重视,存在运行成本控制观念淡薄、运行成本控制制度不健全、运行成本控制方法落后等诸多问题,造成资金使用效率低下和成本的浪费。笔者从事海巡船艇管理工作,深有体会海巡船艇成本控制的不足,希望通过本文的研究提高海巡船艇运行成本控制能力,降低海巡船艇运行成本。本文首先阐述了海巡船艇运行成本控制研究背景、研究意义及其理论基础,分析厦门海事局海巡船艇运行成本控制的现状。其次通过阅读大量的文献资料,调研了其他兄弟单位海巡船艇成本控制现状,分析存在的问题和原因。最后运用公共选择理论、新公共管理理论和船舶管理专业知识,提出具体成本控制对策,笔者认为应从培树海巡船艇运行成本控制观念和绩效意识、完善海巡船艇运行成本制度、注重人员素质的培养和提升、实施单船预算绩效、加强重点支出项目成本控制等方面入手,控制海巡船艇运行成本提高资金使用效率。