金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）是一种革兰氏阳性条件致病菌,主要定植于宿主鼻腔内部,在合适的条件下极易感染宿主皮肤或组织,进而引发菌血症等疾病。甲氧西林作为β-内酰胺类抗菌药物自发现之初,主要用于治疗金黄色葡萄球菌感染,1961年首次出现有关甲氧西林耐药的金黄色葡萄球菌报道。近些年发现的金黄色葡萄球菌被认为对很多β-内酰胺类抗菌药物都表现出多重耐药性,因此这类金黄色葡萄球菌统称为甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌（Methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA）。以前 MRSA 主要在医院的ICU、烧伤科等病房流行。随着社区获得性MRSA发现,尤其是有关动物源MRSA感染人报道,MRSA越来越引起人们的关注。本研究在中英合作项目的支持下,通过采集样本,对临床健康猪群中的MRSA和不同医院来源的MRSA进行分离和鉴定,对分离MRSA进行药敏试验,获得耐药表型结果,比对不同来源MRSA耐药表型差异。同时基于全基因组测序对MRSA耐药表型和耐药基因进行关联分析,从耐药性角度分析不同来源MRSA流行特征、分布趋势和进化关系。1.MRSA耐药表型试验通过BD phoenix system对所有分离获得549株MRSA和297株MSSA进行17种医用抗菌药物的药敏试验。同时结合CLSI标准,使用琼脂稀释法获得了从猪场、医院和屠宰场分离MRSA与MSSA共计927株金黄色葡萄球菌对13种兽用抗菌药物和万古霉素的耐药表型结果。基于琼脂稀释法MIC耐药表型结果,猪场分离MRSA对不同种类抗菌药物耐药谱共有209种,其中38种耐药谱含有的菌株数量大于1即为这些菌株耐药表型相同,猪场分离MRSA的产生与地区分布、分离MRSA数量及本地区其他猪场MRSA阴性率没有直接关系。猪场工作人员鼻拭子分离的MRSA和环境、母猪、育肥猪分离的MRSA的耐药谱之间相互交流。医院分离MRSA耐药谱结果共有203种,2种耐药谱含有相同菌株。同时医院菌株和猪场菌株之间并没有发现具有相同耐药谱的MRSA。2.MRSA耐药表型和耐药基因型关联性分析基于耐药基因数据库,一共筛选出79种耐药基因。有20种耐药基因在猪场分离MRSA中存在比例超过90%,有10种耐药基因在医院分离MRSA中存在比例超过90%。耐药基因在不同来源分离MRSA存在很大差异。耐药基因和耐药表型进行关联分析发现,猪场分离MRSA检测到的耐药基因与耐药表型结果高度一致,含有相关耐药基因的MRSA对同种类抗菌药物表现出了高耐药性。和猪场分离MRSA相比,医院分离MRSA的耐药基因表型和基因型结果差异较大,部分医院分离MRSA对一些抗菌药物表现出强耐药性但并没有检测出相关耐药基因,同时部分医院分离MRSA检测到了 β-内酰胺类抗菌药物、大环内酯类和四环素类抗菌药物相关耐药基因,但耐药表型结果表现为敏感。基于上述结果,本研究得出猪场分离MRSA对全部13种,10大类兽用抗菌药物和喹诺普丁等医用抗菌药物有很强的耐药性,不同来源猪场分离MRSA表现出相同耐药表型,耐药基因种类高度相似,猪场封闭的环境为MRSA之间耐药基因传播提供有利条件。医院分离临床MRSA耐药性整体低于猪场分离MRSA,但医院分离MRSA来源广泛,耐药表型差异明显,耐药基因种类分布多样,加大了不同来源耐药基因相互传播风险。在猪场分离MRSA和医院分离MRSA耐药表型结果和耐药基因分布之间的差异为可能含有的新的耐药基因和新的耐药机制的研究指明了方向。