芸薹属同源异源多倍体和雌不育附加系的创建及遗传分析

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hznewblue
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
多倍体物种的形成与进化是被子植物遗传多样性的重要来源。由于芸薹属三个二倍体种(白菜型油菜,基因组AA;甘蓝,CC;黑芥,BB)之间的成对杂交进化产生了三个异源四倍体种(甘蓝型油菜,AACC;芥菜型油菜,AABB;埃塞俄比亚芥,BBCC),故通过这六个栽培种之间的多种杂交组合可人工合成自然界没有的异源六倍体(AABBCC)、同源异源多倍体,以创建新的种质资源、甚至培育新的芸苔属作物。本研究通过三个芸苔属异源四倍体种与各自的二倍体祖先种杂交及染色体加倍,创建同源异源六倍体,并利用荧光原位杂交技术(FISH)分析了减数分裂行为;随后,利用六倍体与对应的四倍体回交获得五倍体,连续自交后筛选获得系列稳定的甘蓝型油菜和埃塞俄比亚芥新类型;另外,通过小孢子培养,获得雌不育的甘蓝型油菜-诸葛菜附加系新材料,并进行表型及基因表达分析,以深入研究雌不育的分子机制。主要结果如下:1.芸苔属同源异源六倍体的合成及细胞学分析以天然的异源四倍体种埃塞俄比亚芥(Brassica carinata,BcBcCcCc,基因组右上角的字母表示来源的物种)、甘蓝型油菜(B.napus,AnAnCnCn)与二倍体种甘蓝(B.oleracea,CoCo)及黑芥(B.nigra,BiBi)杂交及染色体加倍后获得三个同源异源六倍体:BiBiBcBcCcCc、BcBcCcCcCoCo及AnAnCnCnCoCo。利用从甘蓝型油菜(中双11)中剥离获得的白菜型油菜(B.rapa,AnAn)与中双11及芥菜型油菜(B.juncea,AjAjBjBj)杂交后获得了特殊类型的两个同源异源六倍体AnAnAnAnCnCn及AnAnAjAjBjBj。FISH分析发现,所有观察的这些同源异源六倍体的花粉母细胞均表现非二倍化的减数分裂行为,染色体配对频率及分离方式在六倍体间存在差异。各个六倍体中四体染色体主要配对形成二价体,而四价体的数量较低(平均数低于2个),呈现C(AnAnCnCnCoCo,BcBcCcCcCoCo)>A(AnAnAjAjBjBj,AnAnAnAnCnCn)>B(BcBcBnBnCcCc)的梯度关系;二体染色体在绝大多数情况下形成二价体。在AnAnAnAnCnCn和AnAnCnCnCoCo中A与C亚基因组间存在部分同源染色体配对,导致单价体的产生,而在AnAnAjAjBjBj、BiBiBcBcCcCc和BcBcCcCcCoCo中二体染色体(Bj,Cc与Bc)以相对正常的二价体方式配对,这表明与A-B或B-C相比,A-C亚基因组更频繁地相互配对。相应的是,在减数分裂后期I,BiBiBcBcCcCc、BcBcCcCcCoCo和AnAnAjAjBjBj中的二体染色体呈均等分离的花粉母细胞比例分别为95.58%、96.66%和95.45%,显著高于AnAnAnAnCnCn(60.34%)和AnAnCnCnCoCo(85.71%)。同样,不同六倍体中四体染色体的均等分离的花粉母细胞比例也有也较大差别,AnAnAnAnCnCn与AnAnAjAjBjBj中分别为46.55%和70.45%,AnAnCnCnCoCo与BcBcCcCcCoCo中分别为68.57%和33.33%,BiBiBcBcCcCc中为58.41%。六倍体的减数分裂行为与花粉育性相关。2.同源异源五倍体的合成及新型埃塞俄比亚芥和新型甘蓝型油菜的创建以六倍体(BiBiBcBcCcCc)作为母本与亲本埃塞俄比亚芥杂交得到五倍体(BiBcBcCcCc)。该五倍体连续自交6代后获得新型埃塞俄比亚芥(2n=34)。这些株系在株高、角果长、每角果粒数、千粒重、开花时间等性状上与亲本埃塞俄比亚芥和黑芥有显著不同。基因组重测序分析发现,新型埃塞俄比亚芥中有16.83%-29.12%的黑芥遗传组分渗入;遗传多样性分析发现新型埃塞俄比亚芥与常规埃塞俄比亚芥品系分别形成了独立的聚类分枝,新型埃塞俄比亚芥株系间也有着较丰富的遗传多样性。利用相同的方法,以六倍体(AnAnAnAnCnCn)为母本与中双11杂交,获得五倍体(AnAnAnCcCc),连续自交5代(S5)后获得在表型上与中双11存在广泛差异的高世代株系。染色体数目调查表明,在S3代约有31.30%的株系单株具有38条染色体,并表现出育性高、结实性好等特点,且与中双11相比,这些株系植株也具有显著的表型变异,如分枝角度变小、角果变短、花期提前等。显然,这些甘蓝型油菜新类型产生的表型变异是在没有引入任何外源基因的情况下产生的,其遗传与表观遗传机制有待研究。3.雌不育的甘蓝型油菜-诸葛菜附加系的表型及转录组分析对单体附加系(MA,AACC+1IO)及其小孢子培养获得的二体附加系(DA,AACC+2 IO)、单倍体单体附加系(HMA,AC+1 IO)、双单倍体(DH,AACC)以及单倍体(H,AC)进行表型观察及幼嫩雌蕊的转录组分析。结果发现,MA的雌蕊在发育早期停止生长,开花后脱落,表现为完全的雌性不育;HMA和DA的雌蕊可以伸长达到正常油菜的长度,且在开花、授粉后还可以进一步伸长,但不能膨大结实。在HMA vs H、DA vs DH、MA vs DH、MA vs DA和MA vs HMA的比较中分别得到了2054,4717,8829,8010和6715个差异表达基因(DEGs),其中47.2%(969/2054),25.8%(1218/4717)、8.5%(746/8829)、5.7%(455/8010)和6.2%(413/6715)的基因分别来自诸葛菜染色体。GO富集分析发现,在DA vs DH、MA vs DA和MA vs DH中,涉及雌蕊发育相关的生物过程被显著富集,例如胚胎发育、胚后发育和果实成熟等。在DA vs DH与HMA vs H的共有差异基因中共鉴定出17个来源于甘蓝型油菜并与胚珠或雌配子发育相关的基因,其中4个基因(PIN1、NAC085、OVA6和COG7)和5个基因(4个INOs、MEE3)分别在附加系雌蕊中被特异性激活和沉默,可能是导致雌蕊发育异常及雌性败育的关键基因。此外,我们还发现雌蕊伸长与膨大可能主要受油菜素类酯(BR)生物合成和信号转导相关基因的表达调控。综述所述,本研究首先合成了5种类型的芸薹属同源异源六倍体,发现其减数分裂中四价体形成及部分同源染色体配对频率存在显著的不同;此外,获得了系列新型埃塞俄比亚芥及甘蓝型油菜,显示出广泛的基因组及表型多样性;最后,分析了外源诸葛菜染色体附加导致的甘蓝型油菜雌性不育的潜在机制,发现附加系基因表达及雌蕊发育同时受诸葛菜染色体数量及甘蓝型油菜基因组倍性的影响。该研究为芸苔属多倍体减数分裂中染色体的行为、基因组稳定性、远缘杂交中的雌性不育机制以及油菜的遗传育种提供了新理解和新种质。
其他文献
世界人口的快速增长给自然环境带来了巨大压力,水稻是世界上仅次于小麦的第二大粮食作物,中国是世界上最大的粮食生产国,水稻耕地面积约94370.8 km~2,占全球粮食产量的21.98%。脱粒是水稻收获过程的重要环节,水稻在联合收获机脱粒滚筒中受冲击、梳刷、搓擦、碾压等作用实现脱粒分离,水稻在脱粒滚筒中的流动主要有轴流和切流两种方式。脱粒元件根据脱粒齿形状可分为钉齿式、纹杆式、弓齿式和板齿式等,其中杆
学位
桃(Prunus persica L.)是我国主要的落叶果树种类之一。桃果实成熟主要集中在夏季气温较高的时期,采后迅速变软。贮藏性和运输性差是制约桃产业健康发展的关键因素。桃果实慢溶型(Slow-Melting Peach)具有挂树期长、贮运性好等特点,是理想的育种种质类型。本研究从桃果实肉质生理学、分子生物学、生物信息学等方面对桃慢溶质进行了遗传机制解析及优异基因发掘,并开展了慢溶质桃为目标的品
学位
狂犬病是一种致死性人兽共患病,由狂犬病病毒(Rabies virus,RABV)引起。每年在全球范围内,造成约59,000人死亡,对人类的生命健康和全球经济产生了严重威胁。RABV潜伏期长,在进入中枢神经系统(Central nervous system,CNS)后大量增殖。目前尚未掌握对狂犬病的有效治疗方法,一旦发病,死亡率接近100%,对人类生命健康造成重大威胁。目前推荐的治疗方法是使用狂犬病
学位
泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)是我国常见的小型经济鱼类。在人工养殖过程中,水中的病原体引起的疾病对泥鳅养殖造成了严重威胁。T细胞受体(TCR)是T细胞表面的特异性受体,在识别和呈递抗原以及激活免疫应答等过程中发挥重要作用。迄今为止,TCRα和TCRβ在病原体感染硬骨鱼中发挥的作用知之甚少。本研究分别用柱状黄杆菌(Flavobacterium columnare)、小瓜
学位
树莓富含生物活性成分,是一类广泛食用的具有多种生物活性的水果。树莓含有大量的酚酸类化合物如花色苷,鞣花单宁,槲皮素和其他生物活性成分,因此,红树莓是抗氧化成分的主要来源之一。花色苷由花青素和一或两个糖苷组成,这是水果、蔬菜和花朵呈现不同颜色(橙色、红色、紫色和蓝色)的原因。花色苷被认为是质子化的分子,具有高溶解性,并且对光氧化和p H值变化更敏感。花色苷在食品工业中的稳定性主要取决于它们的结构。花
学位
氮素是棉花生长发育过程中需求量较大的营养元素,也是棉花产量品质的决定因素之一。随着棉花产业的发展,在稳定棉花产量品质的同时减少氮肥施用是棉花生产中亟待解决的重要问题。通过研究棉花氮素高效利用的生理调控机理,挖掘棉花自身氮素高效利用的遗传潜力,提高棉花氮肥利用效率,是减少氮肥用量有效且经济的途径。本实验室从全国270个棉花品种中筛选得到了氮效率差异较大的品种:氮高效品种CRI 69和ZZM 1017
学位
动物的免疫抑制疾病严重影响着现代畜禽养殖业的发展,给社会发展和人类健康带来了较大的影响,如何增强动物机体免疫力、提高疫苗的免疫效果,成为当今急需解决的问题。刺五加多糖(Acanthopanax senticousus polysaccharide,ASPS)是刺五加干燥的根茎或树皮经水提醇沉提纯得到的多糖,具有增强机体抵抗力、抗肿瘤、抗氧化、调节血脂等生物活性,可以作为一种免疫增强剂来使用。兽医临
学位
水稻纹枯病(Rice sheath blight)是世界最严重的水稻病害之一,其病原为死体营养型病原真菌茄丝核菌(Rhizoctonia solani)。茄丝核菌中的真菌病毒非常丰富,部分真菌病毒会引起寄主真菌表型的变化。对纹枯病菌中真菌病毒的研究,不仅为真菌病毒的分类与进化提供了更多的资源和线索,也对真菌病毒与寄主真菌互作及病原菌致病机制研究提供了新思路。本论文主要对湖北省襄阳地区分离的水稻纹枯
学位
棉花(Gossypium hirsutum)是我国最主要的农业经济作物之一,是主要的工业纺织原料和农业榨油原料的来源。在棉花中建立有效的研究基因组学的技术方法,对深入研究棉花功能基因的分子机制具有重大的意义。本研究旨在建立多种适用于棉花的植物CRISPR技术,为棉花功能基因的深入研究提供更多的工具。首先,利用菜豆矮缩病毒(BeYDV)滚环复制的功能,结合棉花CRISPR-Cas9基因编辑系统,共同
学位
甲烷和氧化亚氮是除二氧化碳之外最重要的两种温室气体。水稻种植面积大约为1.633亿公顷,是世界上主要的粮食作物之一。稻田是大气中甲烷和氧化亚氮排放的重要来源,而水稻植株是稻田甲烷和氧化亚氮排放的主要途径。因此,研究水稻植株对稻田温室气体的影响机制对于水稻的栽培具有重要意义。水稻品种是影响稻田甲烷和氧化亚氮排放的重要因素之一,许多研究表明不同水稻品种间的甲烷和氧化亚氮排放具有显著的差异。目前的研究主
学位