在中国西部大开发的进程中，新疆的发展与稳定是关键。随着新一轮的对口援疆计划的实施，新疆的跨越式发展和长治久安成为整个中亚地区的主题。稳定、发展与长治久安都离不开对新疆地区的人力资源开发，尤其是人力资本开发。在整个新疆视域内，开发和提升南疆地区的人力资源水平又是更为关键的因素。以高等教育视角审视南疆地区的人力资本开发问题，不言而喻是一件具有高度实践价值和理论意义的历史命题。本研究以发展为立场，关注南疆地区的人力资本水平和高等教育发展及它们的互动问题，力求寻求合理的能提升区域人力资本水平的区域高等教育发展对策。主要采用定性与定量相结合的方法，在区域高等教育发展与区域经济发展的理论视角下，分析南疆地区的人力资本水平现状和高等教育发展现状。在实证分析方面，选取喀什地区作为个案分析，采用道格拉斯—生产函数模型计算喀什地区的高等教育收益率，进一步确定南疆地区高等教育在人力资本水平提升过程中的作用和地位。最后，提出基于人力资本水平提升的南疆高等教育发展战略措施。研究中发现：南疆地区高等教育发展水平和人力资本开发水平都是相对较低级的，几乎陷入“培养不出人才，也吸收不到人才”的恶性循环怪圈；像其它区域一样，南疆地区高等教育对人力资本的影响主要凸显在存量和投资上，存量上表现为薄弱的高等教育投入导致“捉襟见肘”的人力资本存量问题（数量不足且出现结构性失业）；在人力资本投资方面，由于较低教育投资收益，加上南疆地区经济驱动的主要动力在纯劳动的投入上，进行高等教育人力资本投资的三大投资主体（个人、社会和国家）更倾向直接的劳动投资；南疆高等教育在提升当地人力资本的过程中，出现了投入薄弱、降级培养和毕业生结构性失业等问题。基于以上的研究发现，结合社会经济发展立场和人力资本理论，本研究提出合理发展南疆地区高等教育事业、科学规划高等教育的人力资本投资和加大民族高等教育力度等南疆地区高等教育发展战略。