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随着2012年中国内部控制规范体系的全面施行，内部审计在上市公司内部控制机制设计及运行中的作用更加突出。内部审计作为内部控制的监督者和评价者，其独立性问题成为提升内部控制水平的关键因素。本文在文献综述、理论分析的基础上，以深交所336家A股主板上市公司为样本，借助stata11.0软件进行描述性统计和多元回归分析方法，针对内部审计独立性及其对内部控制水平的影响问题作了较深入的探讨。文章主要包括以下几项内容：第一，回顾了内部审计独立性、内部控制水平以及内部审计对内部控制水平影响的相关文献；第二，分析了内部审计与内部控制相关的理论基础，包括委托代理、信息不对称等理论，提出了本文的研究假设；第三，描述了我国内部审计独立性与内部控制水平的现状，设计内部审计独立性的度量方法，即对每种内部审计机构的隶属层级进行赋值，并以此作为本文的解释变量，同时选取2011年财政部课题组发布的中国上市公司内部控制指数度量上市公司的内部控制水平；最后，通过选取深交所336家A股主板上市公司的内部审计机构的隶属层级等数据，构建了实证模型，进行描述性统计以及多元回归分析，得出了实证检验结果与研究结论。本文的研究结果表明内部审计独立性对内部控制水平有显著的正向影响，当具备较高独立性的内部审计机构开展内部审计活动时，上市公司的内部控制水平较高。本文的研究结论为有关内部审计独立性对内部控制水平影响的研究提供了参考资料，为上市公司提升内部控制水平、监管部门监管策略的选择以及投资人的理性决策提供了参考与帮助。本文综合运用了文献研究法、定性研究与定量研究相结合的方法。在回顾内部审计独立性与内部控制水平研究的相关文献的基础上，对内部审计独立性、内部审计机构的隶属层级等相关概念进行定性分析，在此基础上结合定量研究，搜集2011年深交所A股主板上市公司内部审计机构的隶属层级等数据，构建回归模型，采用描述性统计、相关性分析及多元回归分析的方法进行实证检验，根据实证结果分析了内部审计独立性对内部控制水平的影响。