自从Linked Data项目被提出以来,大量的开放关联数据被发布到Linked Open Data平台上,这其中就包含许多的生物途径数据集。传统的生物途径可视化工具多是基于单一的关系型数据库,可视化工具与单一数据库紧耦合,无法完成Linked Data的多源生物途径数据的可视化工作。因此,本文对基于Linked Data的多源生物途径数据可视化系统进行了研究。本文首先通过分析不同生物途径中组成元素与关系的特点建立了基于分类的生物途径可视化模型,包括代谢网络可视化模型、基因表达网络可视化模型、基因调控网络可视化模型和细胞信号转导通路可视化模型。这四种生物途径可视化模型能够形式化地表示各生物途径组成元素与关系的特点,为生物途径可视化展示方案的设计提供了依据。基于生物途径可视化模型提出了生物途径可视化的展示方案,包括力导向图布局与Sankey图布局,能够交互地展示生物途径。并对生物途径可视化系统界面进行设计,包括菜单栏、基本描述信息、统计可视化、生物途径布局、交互功能和查询功能。本文还基于本体映射技术实现了多源生物途径数据的动态集成。根据查询类型实现不同数据源之间标识符的动态映射,增加了本体映射的灵活性。最后,本文对生物途径可视化系统进行设计与实现。对系统进行架构设计和详细设计并实现一个生物途径可视化系统验证了以上研究的有效性。本文提出了生物途径可视化模型、展示方案和多源生物途径数据动态集成方案,实现了多源生物途径数据的可视化,与之前的仅仅基于某一特定数据库的生物途径工具相比,可以同时一次性展示多个数据集中的生物途径数据及与其相关的其它生物化学数据,给生物领域用户提供了多源数据浏览服务。