弗兰克氏菌(Frankia)遗传多样性分析

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物种多样性是生物多样性的一个重要层次,基于资源与环境可持续发展的要求,物种多样性研究越来越受到广泛重视.遗传多样性是指地球上所有生物所携带的遗传信息的总和,一般指种内的遗传多样性,即种内个体之间或一个群体内不同个体的遗传变异总和.种内的多样性是物种以上各水平多样性的最重要来源.放线菌(Actinomycetes)是与人类关系极为密切的一类微生物,它们广泛存在于不同自然生态环境中,可以产生多种有用代谢产物,是应用价值广泛的生物资源.弗兰克氏放线菌(Frankia)是与植物共生结瘤固氮的,意义不亚于豆科植物的根瘤菌,具有更广阔的研究开发前景.该文综述了放线菌作为资源微生物的重要价值,并介绍了弗兰克氏菌(Frankia)的研究进展和发展趋势,同时介绍了当前研究放线菌遗传多样性主要采用的技术方法及其研究进展.该研究采用实验室保藏菌株和从沙棘、胡颓子中分离得到的弗兰克氏放线菌菌株,进行培养,研究其形态特征.由于它具有生长极其缓慢的特点,经培养得到的菌体量非常少,致使其DNA提取相当困难,摸索出了从极少量菌体中痕量提取DNA的有效方法——CTAB+反复冻融法.对其DNA进行16S-23S rDNA间隔区PCR扩增,并对其产物进行琼脂糖凝胶电泳、温度梯度凝胶电泳(TGGE),研究弗兰克氏放线菌的遗传多样性.另外还通过REP-PCR扩增,对其产物进行琼脂糖凝胶电泳,分析其遗传多样性,实验中经过一系列温度梯度的摸索,找出不同类型的弗兰克氏菌REP-PCR扩增的最适温度.通过这几种方法的研究,证明弗兰克氏菌具有很大的遗传差异性,而且TGGE能更准确的反映生物的遗传多样性,是研究生物遗传多样性非常有效的方法.
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