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本研究以长江口海洋牧场示范区海域生态系统为研究对象,以海洋牧场北部靠近长江口海域生态系统(以下简称对照海域)为对比对象,根据2016年3月、8月、11月对两个海域的生物资源调查数据,运用Ecopath with Ecosim 6.5软件,构建了长江口海洋牧场示范区海域及对照海域生态系统的Ecopath模型。本研究覆盖了两个海域大部分的能量流动,对长江口海洋牧场示范区海域及对照海域生态系统结构与功能进行研究,对长江口海洋牧场生态系统进行评价,为海洋牧场的增殖放流及养护方向提供理论基础。主要结论如下:(1)长江口海洋牧场示范区海域根据采样生物共划分14个功能组,对照海域生物共划分15个功能组。长江口海洋牧场海域功能组营养级为1—3.77,对照海域功能组营养级为1—3.80,其中浮游植物和碎屑功能组营养级最低,中下层游泳生物食性鱼类和底层游泳生物食性鱼类营养级最高。两个海域生态系统生态营养效率大于0.9的功能组都有6个,长江口海洋牧场海域生态营养效率最大为0.97,对照海域生态营养效率最大为0.96,生态系统能量利用率不高。(2)长江口海洋牧场示范区海域及对照海域的生态系统营养级主要存在于第I~第IV营养级,其中能量流动到第Ⅰ营养级所占比例最大,流动到第Ⅳ营养级所占比例最小。长江口海洋牧场示范区海域及对照海域生态系统中各营养级初级生产者及碎屑总的能量转化效率为7.505%、6.06%。两个海域在第Ⅱ、第Ⅲ营养级上的能量转化效率都处于一个较低的水平,但长江口海洋牧场海域能量转化效率高于对照海域。(3)两个海域生态系统主要能流途径有两条:牧食食物链和碎屑食物链,牧食食物链的比重高于碎屑食物链。(4)通过对比两个海域的总消耗量、总输出量、总呼吸量和流向碎屑总量,长江口海洋牧场示范区海域生态系统规模较小。两个海域的TRR/TR为1.244、1.886,均大于1,两个海域的生态系统都不够成熟。两个海域的联结指数CI为0.55、0.52,两个海域杂食性系数SOI为0.252、0.244,都处于较低的水平。通过对比两个海域TRR/TR、CI、SOI,长江口海洋牧场生态系统更成熟。(5)两个海域生态系统Ecopath模型pedigree指数均大于0.5,整个模型具有一定的可信程度,模型质量可以接受。通过以上分析可以得到,长江口海洋牧场建设对提高海域的生态系统成熟度有着促进的作用,生物间联系更紧密,联结度更高,但存在着生态系统不够成熟、食物网结构简单、能量利用率低、建礁规模小等问题。