【摘 要】
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目的:运用生物信息学方法构建加权基因共表达网络筛选可能影响脓毒症预后的枢纽基因。方法:获取美国生物技术信息中心(NCBI)的基因表达数据库(GEO)中的脓毒症患者和健康人群
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目的:运用生物信息学方法构建加权基因共表达网络筛选可能影响脓毒症预后的枢纽基因。方法:获取美国生物技术信息中心(NCBI)的基因表达数据库(GEO)中的脓毒症患者和健康人群外周血基因芯片数据GSE54514,利用R语言WGCNA包构建脓毒症患者与健康人群差异基因的共表达网络,筛选与脓毒症预后相关的模块与枢纽基因,并对与脓毒症预后最相关模块进行基因功能富集分析。结果:通过脓毒症患者和健康人群的622个差异表达基因构建共表达网络,筛选得到与脓毒症预后相关性最大的模块。GO富集分析显示该模块中的基因与髓系细胞的激活、中性粒细胞的激活相关;而KEGG通路富集分析显示这些基因在病毒感染过程中具有重要作用。最后通过构建蛋白质互相作用网络在与脓毒症预后相关性最大的模块中筛选得到15个枢纽基因。结论:通过生物信息学方法挖掘了与脓毒症预后相关的枢纽基因,它们可能参与机体对病毒感染的免疫应答来影响脓毒症预后。
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