本研究利用26个微卫星标记分析了固始鸡和安卡鸡为亲本制备的F2代分离群体共686个个体各标记座位的等位基因数、基因频率、杂合度和多态信息含量,同时测定F2群体的27项生长性状指标,对其进行描述性统计分析和相关性分析,采用方差分析法对标记与性状进行连锁分析,并对性状连锁的同一标记不同基因型作多重比较,试验结果如下： 1、对27项生长性状描述性分析结果表明,群体内个体间存在较大的差异,适于进行标记-QTL的连锁分析。 2、从已发表的三个参考家系的遗传图谱中选取26个微卫星标记,合成引物对F2群体进行PCR扩增,12％变性聚丙酰胺凝胶电泳分型,结果表明：各座位均表现出不同程度的多态,平均等位基因数约5个,最多的ADL326为6个,最少的MCW120为3个,平均杂合度为0.7730,平均多态信息含量为0.6180。 3、采用方差分析法对26个多态性座位与27项生长性状间进行连锁分析,结果表明：26个多态性座位中共检测到16个与不同的生长性状存在相关关系,具有较高的检测效率。它们分别为ADL716、MCW062、MCW236、ADL166、ADL326、ADL298、MCW166、MCW157、ADL267、MCW120、LE1147、LE1070、LE1077、ADL169、MCW193和ADL146。 4、微卫星标记与27项生长性状间方差结果表明:ADL176座位可能与4周龄体重、胫长、胸深,8周龄胸骨长、体斜长、盆骨宽连锁；MCW120座位可能与4周龄胸骨长、体斜长、盆骨宽,8周龄胸骨长、胫围连锁；MCW062座位可能与4周龄胸深、胸角,8周龄胫长、12周龄胸角连锁；ADL267座位可能与8周龄胫长、4周龄胸骨长4周龄骨盆宽连锁；LEI147座位可能与4周龄胫长、胸深、骨盆宽、8周龄胫长、体斜长和12周龄胫围连锁；LEI070座位可能与4周龄胫长、胸深、8周龄胫长、胫围、胸角、体斜长,12周龄体重连锁；MCW166座位可能与4周龄体重、胸角、骨盆宽：8周龄胫长、胫围、体斜长；12周龄体重、胫长、胫围、体斜长连锁；ADL146座位可能与4周龄体重、胫围、体斜长连锁；MCW157座位可能与4周龄体斜长、12周龄胸深、盆骨宽连锁；ADL298座位可能与8周龄胫围、胸宽、体斜长连锁；ADL326座位可能与4周龄体重、8周龄体重、12周龄胸骨长、盆骨宽连锁；MCW236座位可能与4周龄胫长、胸深、胸宽、8周龄胫长、胸骨长、12周龄胸宽连锁；ADL169座位可能与4周龄体重、胫长、胫围和8周龄体重连锁。 5、与性状连锁的同一标记不同基因型间作多重比较,结果表明：标记MCW120中的BC型对8周龄胫围、胸骨长,4周龄盆骨宽显著影响；标记ADL176中的AD型对4周龄体重、8周龄体斜长影响显著,CC型对8周龄胸宽、胸骨长、盆骨宽影响显著,CD型对4周龄胸深影响显著：标记MCW062中的CC型对4周龄胸深、胸角影响显著,BD型对12周龄胸角影响显著,AA型对8周龄胫长影响显著；标记ADL267基因型中的CD型对4周龄胸骨长、盆骨宽影响显著,BD型对8周龄胫长影响显著；标记LEI147基因型中的BB型对4周龄胫长、胸深、盆骨宽影响显著；标记MCW166基因型中的AB型对4、12周龄体重、8、12周龄胫长、12周龄胫围、体斜长、8周龄体斜长影响显著；标记LEI070基因型中的AD型对12周龄体重、胫围、胸角、体斜长,4、8周龄胫长、4周龄胸深影响显著；标记ADL146中的AA型对4周龄体重、体斜长影响显著；标记MCW193基因型中的AC型对4周龄胫长影响显著；标记LEI070基因型中的BC型对8周龄胫长、8、12周龄体斜长影响显著；标记ADL166各基因型中的BB型对4周龄体重、胫围、盆骨宽影响显著；标记ADL326中的AC型对12周龄胸骨长、盆骨宽影响显著；标记MCW236中的BD型对4、5周龄胫长、4周龄胸深、12周龄胸宽影响显著；标记ADL169中的AD型对4周龄体重、胫围影响显著,CD型对4周龄胫长影响显著。