ATM基因多态性与放射性肺炎关联性的初步研究

来源 :川北医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ybchen123
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目的:放射性肺炎(radiation pneumonitis,RP)是胸部肿瘤患者放疗后常见的毒副反应,以往研究显示遗传因素在RP发生中发挥重要作用。共济失调毛细血管扩张突变基因(ataxia telangiectasia mutated,ATM)是引起毛细血管扩张性共济失调症的常染色体隐性突变基因,所编码的蛋白质ATM 参与了 DNA 双链断裂(DNA double-strand breaks,DSBs)修复过程。关于ATM基因rs189037位点和rs373759位点的突变等位基因A是否为患者发生RP的风险等位基因,以往的研究结论不一致。本研究对以往单中心的RP易感基因关联研究进行筛选和meta分析,探究ATM基因单核苷酸位点(rs189037,rs373759)是否与RP发生风险具有显著关联性,以获得一个更准确、客观的结果。随即,对关联位点在肺癌人群中的基因型分布进行流调,并检测不同基因型携带者的ATM蛋白相对表达水平,为进一步的功能位点鉴定奠定基础。方法:检索 2001 年 1 月至 2020 年 2 月 Pubmed、Web of Science、Embase、中国知网(CNKI)和万方数据库中ATM基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点与RP易感性的病例对照研究文献数据。计算95%置信区间(confidence interval,CI)下的合并比值比(odds ratio,OR)比较不同遗传模型下的差异。此外,收集2020年10月至2021年2月在西部战区总医院住院的肺癌患者175例,通过测序进行两关联位点的基因型分布流调,定量PCR检测不同基因型携带者的ATM蛋白相对表达水平。结果:总共纳入6篇原始文献,涉及235例放射性肺炎病例组和957例对照组的数据进行meta分析。结果发现rs189037(AA vs GG,OR=1.62,95%CI=1.03-2.55,P=0.04;AA+AG vs GG,OR=1.58,95%CI=1.10-2.27,P=0.01)和rs373759(AA+AG vs GG,OR=1.47;95%CI=1.03-2.09,P=0.03)两个位点均与发生RP的风险显著相关。rs189037 A等位基因携带者发生RP的风险是携带G等位基因患者的1.35倍(A vs.G,OR=1.35,95%CI=1.08-1.69,P=0.01);突变纯合子AA携带者发生RP的风险是野生基因型GG携带者的1.62倍(AA vs.GG,OR=1.62,95%CI=1.03-2.55,P=0.04)。rs373759 A等位基因携带者发生RP的风险是携带G等位基因患者的 1.31 倍(A vs.G,OR=1.31,95%CI=1.02-1.68,P=0.03);显性遗传模型中突变等位基因A携带者发生RP的风险是GG基因型携带者的 1.47 倍(AA+AG vs.GG,OR=1.47;95%CI=1.03-2.09,P=0.03)。对西部战区总医院肿瘤诊治中心肺癌人群中两关联位点rs189037和rs373759的基因型分布情况调查显示:AA/AG/GG三种基因型在性别、年龄、吸烟史、病理类型、病理分期、是否远转的各亚类肺癌患者中的分布均无显著差异。提示放疗前检测ATM蛋白基础表达水平对于预测RP的发生无用,而应检测患者RP关联位点的遗传变异。结论:ATM基因rs189037和rs373759均为肺癌患者发生2级及以上RP的风险易感标记位点。两位点三种基因型的分布及ATM蛋白表达基础水平无显著差异。
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