我国货币市场建于20世纪80年代,与股票市场相比起步较晚。在体制的约束下,经历了市场建立初期规模小、流动性低、利率非市场化等诸多问题。随着我国金融市场深入与开放程度不断提高,金融市场的复杂度与风险不断加大,相应地对货币政策实施也有更高的要求。在这样的背景下,我国货币市场作为短期资金融资市场及货币政策实施渠道显得越发重要。本文选择了我国货币市场中较具有代表性的两大市场：银行间同业拆借市场与银行间质押式回购市场。文章分别从货币市场利率变动的差异及共同因素角度出发,研究我国货币市场中的银行间市场利率特征与影响因素。影响因素包括货币政策、资本市场以及宏观经济对于货币市场利率的影响与方式。利率变动差异分析中,本文发现我国两大货币市场都存在一定不同期限利率市场分割,并于2004年后有所加剧,这与产品结构不断集中以及股票市场资金需求的冲击有关。相较之下,同业拆借市场有明显的中短期与长期的利率变动不一致,其市场分割的情况较质押式回购市场严重。另一方面,流动性风险、信用风险与两大市场面对外部冲击反应程度的不同是两大市场利差的重要原因。对共同因素的分析中,本文使用向量自回归的方法,对货币政策、资本市场、宏观经济对货币市场利率的影响大小与方式进行深入分析。货币政策整体上在短期、尤其中长期是解释货币利率不确定性的最重要的因素。宏观变量在长期的影响在大部分情况下仅次于货币政策。而资本市场(股票市场)因素主要在短期对特定期限利率影响较高。相比较而言,质押式回购市场受到资本市场影响更大。以上三大因素对我国货币市场利率期限结构影响有所不同,货币政策以及宏观因素长期是利率水平变动的主要影响因子。股票市场冲击是期限结构斜率的主要影响因子。货币政策与股票市场冲击长期对货币市场利率曲度因子有一定影响。总体而言,以上因素都对货币市场利率有影响。相反货币市场利率对股票市场以及宏观经济影响较小,目前两大市场利率尚未起到一个市场基准利率的作用。鉴于以上研究结果,本文认为今后应进一步完善货币市场机制,尤其是同业拆借市场。包括增加市场流动性、增强参与主体的活跃度与多元化,进一步完善产品结构。另一方面,从利率风险角度,应对股票市场的风险输出有所戒备,防止股票市场波动引起货币市场的过度波动。