自2013年9月提出建设自贸试验区的开放战略以来,中国已在21个省级行政区设立自贸试验区,成为持续扩大对外开放和区域经济增长的重要引擎。创新驱动发展是自贸试验区总体建设方案中的重要内容,现有文献中部分学者注意到了自贸试验区设立对于创新活动的影响,但未能深入到创新效率这一视角,因此本文基于多期双重差分法研究自贸试验区的设立对区域创新效率的影响和作用机制。本文首先基于随机前沿函数法测算了2006-2019年中国30个省份（西藏数据缺失）的区域创新效率,发现中国各省份的区域创新效率呈现稳定增长的态势,但区域创新效率的总体水平较低,尚有较大的进步空间,经济发展与区域创新效率并不直接相关。其次,本文基于多期双重差分法来构建实证模型,在控制双向固定效应后回归结果表明,自贸试验区的设立能够有效推动区域创新效率提升。同时本文从地区、设立批次和创新主体三个角度分析自贸试验区设立对区域创新效率的差异化影响。再次,本文采用逐步回归法和Bootstrap方法验证自贸试验区设立对区域创新效率的影响机制,结果表明自贸试验区设立会通过促进贸易增长、外商直接投资增长和推进市场化改革进而提升区域创新效率。接下来,考虑到创新活动的空间相关性,本文使用空间杜宾模型分析发现自贸试验区的设立并未对邻近地区内的区域创新效率产生明显影响。此外,本文通过替换区域创新效率测算方法、共同趋势检验、安慰剂检验等方法验证了实证分析结果的稳健性。最后,依据研究结论本文针对如何通过自贸试验区战略提升区域创新效率提出了针对性建议,包括:推动自贸试验区建设与发展、复制推广自贸试验区制度创新经验、强化自贸试验区稳外贸和稳外资的作用、加快自贸试验区的市场化改革进程等。