土地征收补偿是城镇化进程中的重要议题,因为土地征收补偿不合理产生的经济、社会问题严重影响到城镇化进程。土地征收与出让价格“剪刀差”的存在对农民利益产生严重剥夺,但目前尚未有人测算过这一损失的具体价值。而完善的土地征收补偿价格体系有助于实现农民的产权利益,避免因征收补偿不合理产生的冲突,推动农村经济社会发展和城镇化进程；对抑制政府的圈地、卖地行为,降低农地显性流失,保护耕地有重要作用；也有助于转变经济增长方式,合理配置土地资源,节约、集约利用土地,实现可持续发展。论文以土地产权理论、地租理论、可持续发展理论和农业补贴理论为基础,构建一个科学合理的土地征收补偿价格理论分析框架,从而纠正长期以来土地征收补偿价格核算中存在的理论偏差和计价方法。首先对土地征收补偿价格扭曲的表现进行分析,在此基础上研究不同成因对农地转用价格扭曲的影响机理,提出农地转用价格扭曲具有政府与市场双重失灵的特征。针对土地征用补偿价格扭曲造成的农民利益受损,提出了土地征收补偿价格矫正的目标,包括实现农地资源优化配置、保护农民权益、保障粮食安全和实现农地资源的可持续利用。其次,研究以工农产品价格“剪刀差”和市场价格确定方法为基础,对土地征收出让价格剪刀差存在的本质、计算方法以及对农地收益价格偏差的矫正思路、模型构建进行了分析。借助“剪刀差“模型和市场价格分析方法分别对1990年——2000年以及2001年——2010年两个时段土地征收造成的农民利益损失进行了核算,得出,1990年——2010年土地征收补偿标准不合理造成的农民利益损失为42985.2727亿元,其中19902000年土地征收补偿造成的农民利益损失为11513.7308亿元,20012010年土地征收补偿造成的农民利益损失为31471.5419亿元,总计21年间对农民的利益剥夺约为4.3万亿元,土地征收补偿价格扭曲造成的农民利益损失占21年间农民总收入的约10%以上,是造成城乡居民收入差距的重要原因。针对政府失灵导致的农地价格扭曲,主要是市场运行不畅,要让市场来决定价格,才能充分发挥市场对资源优化配置的重要作用,因此,需要建立农地转用的市场体系,完善土地征收的市场化运行机制,并加强土地用途管制。对于市场失灵造成的价格扭曲需要克服外部性的影响,通过产权界定等实现外部性内部化,形成农地完全价格,从而实现农地资源配置的社会最优,推动经济的可持续发展,保障农民利益。最后对完善农地征收补偿价格体系提出路径设计及对策建议,并从土地征收后补偿机制建立、动态补偿、土地留用模式和土地资本化等方面谈了土地征收补偿机制的创新。