胚胎发育过程中,从定型内胚层(Definitive Endoderm,DE)到肝向的细胞命运转变实际是由相关转录因子和它们的下游基因的活性决定的。在DE高表达的两个转录因子Foxa2和GATA4被称为肝向分化中的“先锋因子”。它们早在DE阶段就已结合到早期肝脏基因albumin的调控区,赋予albumin在随后的肝脏发生中激活表达的能力。但是,Foxa2和GATA4这种预先激活下游基因表达的“先锋”作用从来没有在更广层面得到揭示。为了研究这个问题,我们建立了一个由胚胎干细胞(Embryonic Stem Cell,ESC)经DE阶段分化至早期肝细胞的高效模型。以此为基础,我们运用ChIP-Seq技术,在分化得到的DE细胞中,鉴定了Foxa2和GATA4在全基因组范围内的结合位点及下游基因。我们在几个肝脏基因Afp,Ttr和Timd2的调控区,都鉴定到了Foxa2和GATA4在DE阶段的共结合位点。此外,结合cONA芯片表达谱研究和ChIP-Seq的数据,我们的结果还提示,在DE的肝向分化过程中,Foxa2和GATA4可能在全基因组水平上扮演这种“先锋”作用。我们的研究是第一次关于肝向分化过程中转录因子Foxa2和GATA4在全基因组范围内转录调控的探索,并且为胚胎发育中的肝脏发生和ESC肝向分化两方面的研究都提供了非常有用的信息。