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促卵泡激素(Follicle-stimulating hormone,FSH)是垂体前叶分泌的一种糖蛋白,可通过卵泡刺激素受体(Follicle-stimulating hormone receptor,FSHR)调节卵巢的功能;蛋白质二硫键异构酶4(protein disulfide iso-merase 4,PDIA4)在猪的成熟卵巢细胞中含量较高,通过影响DBD区的构象来改变下游相关基因对雌激素受体α(estrogen receptorα,ERα)的调节应答,从而影响卵泡的发育。为了研究猪FSHR基因和PDIA4基因的多态性及其与产仔数的关系,以从江香猪为研究对象,采用AS-PCR技术和PCR产物直接测序方法检测基因的多态性,分析基因型与香猪产仔数间的关系。对于FSHR基因,8个候选位点进行群体检测证实其中2个为SNP位点,包括rs322800083(C276T)和rs332115220(T601C),且新发现一个SNP位点novel 1(G-92A);rs322800083和rs332115220位点构成4种单倍型,其中C-T为香猪群体的主要单倍型(45.0%),且在香猪群体中处于连锁状态(r2=0.334)。分析4种单倍型与香猪产仔数间的关系,在香猪的2胎产仔数中,单倍型C-T的总产仔数最高,单倍型C-C对应的产仔数最少,两者之间的TNB相差1.0头(P<0.05);在香猪的3胎产仔数中,单倍型C-T的总产仔数最高,与单倍型T-C、C-C间的TNB分别相差1.6头和2.3头(P<0.01)。rs332115220位点的基因型与香猪的三胎产仔数呈弱的正相关关系(ρ<0.429)。研究结果提示单倍型C-T可以作为分子标记应用于香猪产仔数性状的辅助选育。对于PDIA4基因,24个候选位点进行群体检测证实其中10个为SNP位点,包括SNP2(rs81216657:C14G、A14G)、SNP3(rs325150081:G146A)、SNP4(rs81216658:C176T)、SNP5(rs343963559:C269T)、SNP6(rs55618851:G443A)、SNP7(rs334600072:G482A)、SNP8(rs342384893:C700T)、SNP9(rs694204126:T758C)、SNP10(rs55618242:C816T)和SNP11(rs340066367:C817T),且新发现一个SNP位点novel 2(C-18G);SNP4位点为同义突变,编码苏氨酸(Thr),高产香猪群体的C等位基因频率显著高于低产香猪群体(P<0.05),且该位点偏向于ACC密码子选择,具有密码子偏好性。经Western Blot测定,rs81216658位点TT基因型的PDIA4蛋白表达量最低,该密码子偏好性有助于PDIA4基因mRNA水平和编码蛋白水平的表达。SNP4和SNP6位点构成4种单倍型,其中单倍型T-A在香猪高产群体中高度紧密连锁(r2=0.854),更趋近于高繁殖力大白猪的连锁类型,在低产群体中仅为低度连锁(r2=0.485),低产香猪群的T-A单倍型与高产香猪群、大白猪的单倍型频率差异极显著(P<0.01)。研究结果提示单倍型T-A可以作为分子标记应用于香猪产仔数性状的辅助选育。