猪四个胴体性状的全基因组关联分析及猪BMP2基因的表达调控初步研究

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zoudfeng
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
猪是我国的主要肉食来源。猪体内脂肪沉积过多不仅降低肉产品质量,而且还会对猪的生长和繁殖性能产生影响。猪胴体性状能够有效的反应出猪胴体的脂肪含量和瘦肉率,因此,研究猪胴体性状的遗传机理具有重要意义。本研究以巴克夏×约克夏F2资源群体为研究对象,应用Porcine SNP60K芯片,采用紧缩混合线性模型(CMLM),在全基因组范围内进行关联分析,筛选影响猪胴体性状的候选基因,为标记辅助选择提供基因标记,所得结果如下:1.最后肋骨处背膘厚关联分析结果:对P值最小的10个SNP位点进行注释,发现这些SNP位点分别位于猪第2、8和18号染色体上。2.第十肋骨处背膘厚和平均背膘厚关联分析结果:对两个性状P值最小的10个SNP位点进行注释,发现第十肋骨处背膘厚中有8个SNP位点位于猪12号染色体,平均背膘厚中有9个SNP位点位于猪12号染色体,都位于14.14~15.93Mb的1.8Mb区域内且高度连锁。这个区域与之前报道过的与脂肪沉积相关的QTL区域重合,对这段区域进行基因注释,发现3个与脂肪沉积有关的基因,分别是GH1、ACE和PITPNC1。3.第十肋骨处眼肌面积关联分析结果:对P值最小的10个SNP位点进行注释,其中6个SNP位点位于猪10号染色体的5.0~5.98Mb的区域内。剩余4个SNP位点分别位于猪第9、14和17号染色体上,经注释得到一个与肌肉发育有关的基因NFATC2。已有的研究结果显示,BMP2基因是与猪瘦肉产量相关的候选基因。目前关于猪BMP2基因的研究并不多,本研究主要对猪BMP2基因进行了表达谱检测,SNP查找、启动子克隆及验证等研究,主要取得以下结果:1.运用实时定量PCR方法,检测BMP2基因在成年大白和陆川公猪的12个组织中的表达。结果表明,在这12个组织中BMP2基因均有表达,在软骨组织中表达量最高,在肌肉组织中表达量较低。2.克隆了猪BMP2基因5’端上游2858bp至1579bp的共1219bp序列。构建了5个启动子序列删减载体,双荧光素酶报告系统检测结果表明猪BMP2基因5’端上游2528bp至2220bp可能存在核心启动子活性区域。3.在猪BMP2基因第三个外显子发现两个SNP位点,分别为同义突变c.1011G>A和错义突变c.1319C>T,其中c.1319C>T能够使第260位氨基酸由丝氨酸变为亮氨酸,且应用生物信息学分析发现该位点可能影响基因的蛋白质功能。4.针对c.1319C>T错义突变构建了野生型(CC型)和突变型(TT型)的真核表达载体,并将其转染PK15细胞,检测了BMP2信号通路下游LOX和PPARG基因m RNA水平表达量的变化差异。结果显示,LOX和PPARG基因在分别转染野生型(CC型)和突变型(TT型)表达载体的细胞中的表达量差异不显著。
其他文献
分蘖是水稻等单子叶植物的一种特殊分枝方式,也是水稻理想株型建立和作物遗传改良的重要因子,水稻分蘖的研究主要表现在分蘖角度的大小和分蘖数的多少两个方面。mi RNA作为一类具有重要调节功能的small RNA分子,主要通过调节植物中的重要转录因子来调控植物的生长发育,为水稻的遗传改良提供了新的基因资源。本研究包含2个方面的内容:一是以水稻MIR160b/MIR167a超量表达植株为材料,利用实验方法
学位
micro RNAs(miRNAs,即微小RNA)是一类18–22nt非编码小分子RNA,可以通过与特定m RNA结合和作用m RNA的蛋白质翻译过程来调控基因的表达。近年来越来越多的研究表明,miRNAs在动物睾丸的发育成熟、各种细胞的功能分化以及精子发生过程中发挥重要的作用。但目前关于miRNAs通过对关键基因的转录后调控来介导精子生成的遗传机制的报道却很有限。课题组前期已经通过miRNAs芯
学位
由茄腐镰孢菌(Fusarium solani)等引起的绿豆根腐病是绿豆上一种常见土传病害,严重为害绿豆,给绿豆生产造成严重损失。本研究对绿豆根腐病生物防治作了初步探索,以实验室现有的18株真菌为材料,通过平板对峙筛选和盆栽防治试验筛选出五株具有生防效果的菌株,即3株木霉菌株T181、T581和T601,以及2株青霉菌株AV12和AV13。采用形态学和分子技术相结合的方法,对T581、T601两株木
学位
猪胎盘属于上皮-绒毛膜型胎盘,它行使支持胚胎生长发育等功能。经历从早期胚胎附植到胎盘褶皱形成及其复杂程度不断增大等过程,同时母胎界面子宫内膜与绒毛膜上皮形态不断发生变化,以满足胎儿生长发育的营养代谢需要。妊娠12-18天为胚胎附植期,早期胚胎分泌雌激素进入子宫腔,刺激子宫内膜产生分泌型磷酸化蛋白1(secreted phosphoprotein 1,SPP1),它能与母胎两侧不同整合素受体复合物结
学位
青翅蚁形隐翅甲是水稻田中重要的捕食性天敌,为稻田捕食性天敌的优势种,捕食转Bt基因稻田植食性害虫可能使其暴露于Bt蛋白,但是有关转Bt基因抗虫水稻对青翅蚁形隐翅甲的安全性评价研究甚少。本文构建了Tier-1体系,评价高剂量Cry1C蛋白是否对青翅蚁形隐翅甲具有潜在毒性,并评价了基于“转基因水稻-褐飞虱-青翅蚁形隐翅甲”食物链传导的Bt蛋白对青翅蚁形隐翅甲的安全性,研究结果如下:1高剂量Bt蛋白饲喂
学位
瞬时表达系统是一种简单快速分析基因功能的方法,在农杆菌上被广泛运用,本研究中将其拓展运用于分泌蛋白胞外表达的模式生物枯草芽孢杆菌上。由avr与R的互作或一些蛋白质激发子诱导产生的超敏反应是植物抗病的一种重要形式,通常伴随着多种抗病相关物质的产生,对植物抗病具有重要意义。本研究主要利用农杆菌和枯草芽孢杆菌瞬时表达系统,通过avr4与Cf-4、avr Rxo1与Rxo1和p50与N基因的gene-ge
学位
母猪的产仔数是由非常复杂的生理机制所调控的,排卵率是衡量母猪产仔数最重要的标准。基因的可变剪切普遍存在于真核生物中,它通过不同的剪切方式产生不同的m RNA剪切异构体,而最终翻译出不同功能特性和结构特性的蛋白质产物,进而对各种生命过程产生影响。有研究指出,基因的可变剪切与动物生殖器官如卵巢、睾丸等的发育有着密切关系。本研究采用转录组测序技术分离鉴定不同猪种排卵前卵泡组织中差异表达的基因,筛选出与猪
学位
胚胎着床是具有活性的囊胚与可接受子宫建立联系的过程,是影响妊娠过程的主要环节。这个过程受到许多的因素调控,而miRNA也参与了这个过程的调控。本试验以妊娠早期第9天、12天和15天以及空怀12天猪子宫内膜为研究对象,每个阶段3个生物学重复,进行miRNA高通量测序。研究结果如下:1.通过高通量miRNA测序,妊娠不同阶段比较后共获得106个差异miRNA。我们在妊娠9天与空怀12天子宫内膜中没有发
学位
现代猪生产中饲料成本约占总成本的70%,提高猪饲料转化效率,节约饲料成本,是提高生猪养殖效益的重要手段。骨骼肌是猪机体最大的组织,所消耗的能量约占总代谢的60%,降低猪骨骼肌能量代谢是提高饲料效率的重要途径。MiRNAs(miRNAs)是一类保守的、长度大约为20-24个核苷酸的微小RNA,它主要通过降解靶标基因的m RNA或者抑制其m RNA的翻译水平进而负调控基因的表达。乳酸脱氢酶(LDH)、
学位
肛门闭锁(Anorectal Atresia;AA)是一种常见的新生仔猪先天性直肠末端发育缺陷,因胚胎期尾端发育异常,肛门没有形成,造成直肠在体表没有开口。猪肛门闭锁自然发生率高达0.1-1.0%,患病公仔猪通常在出生后1-3天内死亡,母仔猪在出生后一月内死亡50%,对养猪生产造成较大经济损失。另外,肛门闭锁在新生儿中发病率高达1/5000,因此,从分子水平探索肛门闭锁的致病基因及其发病机制具有十
学位