目的:通过分析健康成年女性、乳腺纤维腺瘤患者、乳腺癌患者三组之间肠道菌群丰度和多样性差异,寻找筛选与乳腺肿瘤相关性较强的菌群,探究乳腺肿瘤与肠道菌群的相关性,为乳腺良恶性肿瘤病情评估、治疗、随访提供参考依据。材料和方法:收集36例健康成年女性,20例乳腺纤维腺瘤患者,36例乳腺癌患者的晨起新鲜粪便标本放入缓存液中,乳腺纤维腺瘤患者和乳腺癌患者的粪便标本均在术前或初次辅助化疗前收集。统一对92例粪便标本进行16S r RNA V4区测序。测序数据进行处理后,对三组间肠道菌群OTU、α多样性、肠道菌群门水平丰度、肠道菌群属水平丰度以及肠道菌群代谢通路进行差异性分析。分析比较得出三组间肠道菌群丰度及多样性差异。三组间菌群数据符合正态分布的通过单因素Anova检验进行分析,非正态分布数据通过Wilcoxon秩和检验进行分析,差异有统计学意义（P＜0.05）。结果:三组92例标本中共获得8625625个高质量序列,平均序列长度约为303bp。在97%相似度下,将其聚类为OTU,共得到4352个OTU,三组间共有的OTU数目是1342,所有样本的测序覆盖率为99.9%。与健康成年女性组和乳腺纤维腺瘤患者组相比,乳腺癌患者组的Simpson指数较低,整体α多样性降低（P＜0.005）。同样,与另外两组相比,乳腺癌患者组也表现出了测序片段数量减少的趋势（P＜0.01）。PCA分析显示,三组间肠道菌群在门水平存在差异。乳腺癌患者组的拟杆菌门（Bacteroidetes）丰度显著低于健康成年女性组（P＜0.001）和乳腺纤维腺瘤患者组（P＜0.05）。乳腺纤维腺瘤患者组厚壁菌门（Firmicutes）丰度显著高于健康成年女性组（P＜0.01）。乳腺癌患者组厚壁菌门（Firmicutes）丰度高于乳腺纤维腺瘤患者组,差异均具有统计学意义（P＜0.05）。与门水平类似,PCA分析显示,三组间肠道菌群在属水平组成也存在差异。在属水平上,从健康成年女性组到乳腺纤维腺瘤患者组和乳腺癌患者组,瘤胃球菌属（Ruminoccoccus）的丰度逐渐增加。瘤胃球菌（Ruminoccoccus）的丰度在乳腺癌患者中最高,在健康成年女性组中最低。罗氏菌属（Roseburia）、布劳特菌属（Blaautia）和粪球菌属（Coprococcus）也有类似的变化趋势。普雷沃菌属（Prevotella）和双歧杆菌属（Bifidobacterium）仅在乳腺纤维腺瘤患者组和乳腺癌患者组的对比分析中有统计学差异。乳腺癌患者组中普雷沃菌属（Prevotella）和双歧杆菌属（Bifidobacterium）的丰度较乳腺纤维腺瘤患者组低。此外,KEGG功能预测分析显示乳腺癌患者组与乳腺纤维腺瘤患者组在次生代谢产物的生物合成和生物降解（Biosynthesis and biodegradation of secondary metabolites）方面存在显著差异。在乳腺癌患者组和健康成年女性组的对比分析中,醚脂代谢（Ether lipid metabolism）方面有显著差异。与乳腺癌患者组和健康成年女性组的对比分析相似,乳腺纤维腺瘤患者组与健康成年女性组之间的醚脂代谢（Ether lipid metabolism）也存在显著差异。结论:乳腺癌患者、乳腺纤维腺瘤患者、健康成年女性的肠道菌群在多样性和物种丰度上均存在差异,表明肠道菌群与乳腺良恶性肿瘤的发生发展有关,本研究为乳腺肿瘤的临床诊治辟了新的思路。