眼蕈蚊科Sciaridae隶属于双翅目眼蕈蚊总科Sciaroidea，是陆地双翅目种群的一个重要组成部分。本文对中国眼蕈蚊科8属进行了系统分类研究，共记录86种，涉及47新种、4中国新纪录属、32中国新纪录种、2个新组合；提供各属的鉴别特征及分布图，对新种和新组合进行了详细的形态描述，对近缘种进行讨论，并提供外部形态特征图，还提供了8属分种检索表。在此基础上，重新整理并编制了中国眼蕈蚊科名录，并编制了中国眼蕈蚊科31属的分属检索表。在分子水平上，基于线粒体基因序列进行系统发育研究。获得2种食用菌害虫，异迟眼蕈蚊Bradysia difformis Frey和平菇厉眼蕈蚊Lycoriella pleuroti Yang etZhang除A+T富含区外的线粒体全基因组序列。通过线粒体基因序列分析，初步了解眼蕈蚊科在双翅目长角亚目中的系统进化地位。此外，采用DNA条形码技术，对迟眼蕈蚊属2个外部形态相近的物种群进行分子鉴定，依据遗传距离和分子系统进化树鉴定为同源性高的2个独立物种。