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目的利用流式细胞术检测肝癌细胞系中的CD90(Thy-1)/EpCAM阳性细胞比例；建立稳定的肝癌细胞系中CD90(Thy-1)/EpCAM阳性细胞筛选方法，初步探讨CD90+/EpCAM+细胞亚群的生物学特性。方法采用五种肝癌细胞系（HepG2，SMMC-7721，Bel-7404，Bel-7403及SK-Hep-1），用含10%胎牛血清的DMEM培养基培养后利用流式细胞分选仪检测CD90(Thy-1)和EpCAM的表达情况，分选出五种细胞中CD90+和EpCAM+细胞亚群。CCK-8法绘制生长曲线观察常规培养条件下CD90+/EpCAM+、CD90-/EpCAM-及未分选细胞的增殖能力；用含有顺铂的培养基培养分选后各细胞亚群，观察它们的抗药能力；分选后的各细胞亚群做平板克隆形成实验观察其增殖能力。结果五种肝癌细胞系中，肝癌细胞系Sk-Hep-1表达CD90阳性率为66.02%，肝癌细胞系HepG2表达CD90阳性率为0.15%， Bel-7404表达EpCAM阳性率为54.94%，SMMC-7721和Bel-7403未见CD90和EpCAM表达。分选后的细胞亚群，体外培养显示4d后CD90+细胞亚群增殖较CD90-及未分选细胞明显快；EpCAM+细胞亚群增殖较EpCAM-及未分选细胞明显快；药物实验中CD90+细胞在相同浓度的顺铂作用下抑制率均较CD90-细胞和未分选细胞明显低，三者的抑制率分别为(36.88±1.44)%、（64.67±1.72）%和（50.72±1.65）%,差异有统计学意义（P＜0.05）；EpCAM+细胞在相同浓度的顺铂作用下抑制率均较EpCAM-细胞和未分选细胞明显低，三者的抑制率分别为（21.73±2.81）%、（49.32±6.23）%和（39.51±9.74）%，差异有统计学意义（P＜0.05）；平板克隆形成试验中CD90+细胞亚群克隆形成率为（18.63±2.41）%，显著高于CD90-细胞及未分选细胞，差异有统计学意义（P＜0.05）。EpCAM+细胞亚群克隆形成率为（21.53±3.27）%，显著高于EpCAM-细胞及未分选细胞，差异有统计学意义（P＜0.05）。结论本实验的结果表明CD90和EpCAM不在同一种肝癌细胞系中表达。从肝癌细胞系中分选的CD90+细胞和EpCAM+细胞具有肿瘤干细胞的特性：自我更新和增值能力，耐药性，以及更强的克隆形成能力。