结核分枝杆菌PPK2核酸适配体的抗结核效果评价

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目的探讨结核分枝杆菌多聚磷酸盐激酶2(PPK2)核酸适配体(aptamer)与体外结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)共培养来评估其抑菌效果。为开发新的高效、低毒的抗结核药物提供新的方向。方法1.运用生物信息学方法分析PPK2蛋白氨基酸序列与呼吸道部分常见病原菌同源性进行分析,并构建PPK2进化树。2.将PPK2核酸适配体与MTB标准株H37Rv、卡介苗(BCG)、耻垢分枝杆菌、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌,通过酶联寡核苷酸分析(enzyme-linked oligonucleotide assay,ELONA)方法测定PPK2核酸适配体与H37Rv结合亲和力,用相同的方法检测PPK2适配体与正常人、结核病人血清中PPK2蛋结合的亲和力。3.将PPK2核酸适配体加入不同浓度血清中共孵育24h,运用琼脂糖凝胶电泳分析其在不同浓度血清中的生物稳定性。4.采用微量刃天青显色法测定PPK2核酸适配体对H37Rv的最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)。5.将H37Rv与1μmol/L的PPK2核酸适配体、随机序列接种到罗氏培养基,观察PPK2适配体与随机序列对H37Rv生长影响。将H37Rv与PPK2核酸适配体、突变体共培养10d,运用酶标仪测定D(600nm)值,观察PPK2核酸适配体对H37Rv的生长影响。6.将H37Rv与PPK2适配体共培养5周,采用结晶紫染色法观察PPK2适配体对MTB生物膜生长的影响。7.将PPK2核酸适配体与细胞共培养,观察核酸适配体对细胞毒性。结果1.生物信息学方法分析构建PPK2进化树显示H37Rv的PPK2蛋白与呼吸道部分常见病原菌亲缘性较远,与铜绿假单胞菌亲缘关系相对较近。2.通过ELONA测定显示PPK2核酸适配体能与H37Rv的PPK2蛋白选择性结合,在正常人与结核病病人血清中PPK2核酸适配体在结核病病人血清表现出较好的亲和力。3.琼脂糖凝胶电泳分析PPK2核酸适配体在血清中至少稳定存在8h。4.PPK2核酸适配体对结核分枝杆菌标准株H37Rv的MIC为50nmol/L。5.罗氏培养基菌落生长显示PPK2适配体对H37Rv生长具有抑制作用。生长抑制试验表明随着PPK2核酸适配体浓度增加H37Rv的D(600nm)值呈现下降趋势,说明PPK2核酸适配体对H37Rv生长存在抑制作用。6.PPK2核酸适配体与MTB共培养5周,经过结晶紫染色法测定显示PPK2核酸适配体影响MTB生物膜形成。7.细胞毒性试验显示高浓度与低浓度PPK2核酸适配体对细胞均无毒性。结论1.PPK2蛋白核酸适配体对体外H37Rv表现出良好的抑菌活性。2.PPK2核酸适配体能够与结核病人血清PPK2蛋白选择性结合。
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