随着经济的不断发展,我国的大部分湖泊都深受富营养化的困扰,尤其是太湖流域,近20年来蓝藻水华现象时有发生。太湖的富营养化问题已经严重制约了流域的社会经济可持续发展,国家及地方政府投入大量的精力进行太湖的富营养化控制,但是效果并不十分明显。本文通过大量文献的查阅及资料的调研,总结国内外关于湖泊富营养化控制的观点,借鉴发达国家的成功经验,对太湖的富营养化现状及控制现状进行了分析。在总结太湖富营养化控制现状的特点、存在的不足,本文分析了目前太湖富营养化控制中存在的问题,主要有控制污染源尤其是控制农业面源污染上的困难、公众参与和环保NGO参与太湖富营养化控制中的困难、太湖的跨行政区域特性给湖泊富营养化控制带来的难题。针对上述富营养化控制困难,本文对相应的控制对策进行了研究。通过建立健全环境保护制度、加强农村环境保护工作的监管、保障农村环境整治的资金投入、鼓励农民自愿参与环境保护、加强环保技术的研究、推广生态农业来控制农村面源的污染。严格控制太湖流域的工业企业数量,对已有企业进行清洁生产审核,改变末端治理的思路；加强污水管网的铺设,加大污水处理厂的兴建力度,提高污水的处理率,提高污水厂的排放标准,最大限度减少污水厂排出的污染负荷。通过以上措施减少点源污染负荷。通过建立排污权交易、排污税的征收和生态补偿等经济手段对污染行为进行调控,控制太湖的富营养化。提高公众的环境保护意识；建立健全法律法规体系；建立富营养化预警系统；加强环境信息共享机制的构建；建立健全基于流域的管理模式。通过以上来完善太湖水污染防治创新机制的构建。