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目的:利用连锁分析法对一个具有常染色体显性遗传特点的国人视网膜色素变性(autosomal dominant retinitis pigmentosa,adRP)家系的致病基因进行染色体定位,明确该家系致病基因是否位于15个已知的adRP染色体位点内,在所定位的染色体区域内筛选可能的致病基因并确定其突变形式。
方法:收集一个视网膜色素变性家系;在征得知情同意后对参加本研究的13名家系成员进行眼科常规检查并采集静脉血样;标准饱和酚/氯仿法提取基因组DNA;在位于第1、3、6、7、8、11、14、17、19号染色体上的15个已知adRP染色体位点(RP18、SEMA4A、RP4、RP1、RDS、GUCA1B、RP9、RP1O、ROM1、RP27、RP17、RP30、RP13、CORD2、RP11)内分别选取3~6个微卫星标记并用聚合酶链反应技术进行扩增:8%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染法对微卫星标记进行基因分型;两点法计算微卫星标记与致病基因之间的最大优势对数值(LOD score);精细定位将致病基因限定在染色体某个区域;对家系内视网膜色素变性患者该区域内已知adRP致病基因全部编码区序列进行直接测序分析;部分单核苷酸多态性位点进行直接测序以及限制性内切酶分析。
结果:一个连续四代发病的视网膜色素变性家系参加了本研究;系谱分析表明致病基因在该家系中以常染色体显性方式遗传;共选取位于15个已知adRP染色体位点的微卫星标记54个;基因分型结果表明26个微卫星标记在该家系具有多态性:RP17位点微卫星标记D17S701和D17S1604两点LOD值分别为2.107和1.806,其余14个adRP染色体位点的微卫星标记两点LOD值均小于-3.000;进一步单体型分析将该家系致病基因定位于染色体17q22,与RP17连锁;家系3名视网膜色素变性患者CA4基因第1-8外显子包括外显子内含子交界区直接测序未发现异常序列改变。
结论:首次将一国人常染色体显性视网膜色素变性家系致病基因所在的染色体位点定位于RP17,CA4基因序列分析却未发现明显基因突变,该家系致病基因突变是否为CA4基因非编码区突变、CA4基因复杂突变(如大片段缺失)或RP17位点是否存在新的视网膜色素变性致病基因尚有待于进一步研究。