过去二十年来,人类生命健康、社会公共卫生安全接受了多次考验,突发公共卫生事件时有发生,SARS、手足口病、甲型H1N1流感、H7N9禽流感、埃博拉、寨卡病毒、新冠疫情等重大传染病疫情,暴露出我国防御突发公共卫生事件的能力薄弱之处。新医改体制下,乡镇卫生院既要做好医疗救援工作,又要与相关部门配合,是突发传染病疫情的前沿和关键环节,责任重大,其应对能力、采取措施是否规范、是否科学直接决定了突发公共卫生事件应对的成败。因此,提升乡镇卫生院的应急能力事关重大、十分紧迫,既要提升应急管理能力,也要不断增强乡镇卫生院疾控能力与应急医疗团队的能力,不断整理与集中医院所拥有的资源,持续的增强乡镇卫生院在处理突发公共卫生事件方面的能力,及时控制与减少突发公共卫生事件带来的负面影响,从而保障居民的人身安全,维护社会和谐稳定。为此,本文以乡镇医院在新冠疫情突发公共卫生事件中应对中能力建设作为研究对象,以佛山市Y乡镇卫生院为例,基于应对本次新冠疫情的反思,采用公共危机管理理论、政府职能理论,分析卫生院资源硬件配置情况、医疗功能运行情况、公共卫生服务功能运行情况,结合卫生院在应对新冠疫情期间在突发公共卫生事件防控制度体系建设能力、监测预警处置能力、专业人才业务能力、应急保障能力、医疗疫情信息化建设能力等五个方面进行研究,分析得出卫生院在应对新冠疫情中的能力建设中存在应急制度体系建设不完善、监测预警处置能力薄弱,专业人才业务能力不强、应急保障能力不足、医疗疫情信息化建设落后的问题,究其原因有应急组织系建设不健全、监测预警体系固化、专业人才队伍建设落后、应急保障缺乏常态化投入、医疗疫情信息化建设落后等。结合卫生院工作实际,有针对性地提出有效应对的管理完善及采取措施,进一步完善卫生院应急组织协调机制,提高卫生院疫情防控管理水平、强化卫生院防控救治人才队伍建设、增强常态化应急保障能力、加大投入提升医疗疫情信息化程度,对提高卫生院在处置公共卫生事件的应对能力建设进行有益探索。