淀粉分支酶在大肠杆菌中的分泌表达及其分子改造研究

来源 :江南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dsfsfsg
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
淀粉分支酶(1,4-α-glucan branching enzyme,简称GBE;EC 2.4.1.18)是一种直接参与淀粉生物合成的糖基转移酶,它能够切断淀粉分子中的α-1,4-糖苷键,并将切下的链段以α-1,6-糖苷键的形式连接至受体链上形成新的分支。关于不同来源的GBE在大肠杆菌(Escherichia coli)中的胞内表达的研究已有很多报导,如果实现其分泌表达,将大大提高应用潜力。此外,目前GBE酶活普遍较低,限制了其工业发展。同时,对GBE结构与功能的研究尚未深入,确定其活性中心将对采用分子手段提高酶活具有十分重要的意义。本论文以来源于Geobacillus thermoglucosidans STB02的GBE为研究对象,首先实现了GBE在大肠杆菌中的分泌表达,并进行机理分析。其次研究了GBE的作用机制,为生产改性淀粉提供理论指导。然后以310位氨基酸为突变对象,探究此位点对催化活性、底物特异性、转苷模式的影响规律。最后,以活性中心处的349位氨基酸为突变对象,构建具有更高酶活的突变体,并分析其可能的机理。主要研究结果如下:(1)实现了GBE在大肠杆菌BL21(DE3)中的分泌表达,在不同发酵条件下进行重复验证,先后考察了初始培养基、发酵温度、发酵时间、初始pH、异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)浓度等因素对GBE分泌表达的影响。结果表明,在不同发酵条件下都能在发酵上清液中测得GBE酶活。尤其是在培养基为TB、发酵温度为30°C、初始pH为7.5、IPTG浓度为0.005 mM的条件下培养48 h最有利于GBE的胞外生产。这是国内外首次关于GBE在大肠杆菌中的分泌表达的报道。(2)探究了GBE不依赖信号肽在大肠杆菌中进行分泌表达的机理。首先,大肠杆菌分泌表达GBE与菌体生长具有明显的同步效应。对GBE进行定位发现细胞各组分中都存在GBE,说明了GBE的胞外运输需要两步跨膜。通过扫描电子显微镜(SEM)和透射电子显微镜(TEM)观察细胞形态结构,排除了由细胞自溶而造成GBE渗漏的可能。其次,通过N-端测序以及构建含有pe1B信号肽质粒发现重组菌分泌GBE的过程与含原载体pET-20b(+)/gbe的重组菌明显不同。说明构建载体pET-20b(+)/gbe时已经去除了pe1B信号肽。接着,分别构建不同载体的重组质粒发现含有不同重组质粒的菌株分泌GBE的过程十分接近,证明GBE的分泌表达不是由载体造成的。利用定点突变构建的保守氨基酸残基突变体(D352N、E452Q、D420N)胞外上清液中均存在GBE且分泌量与野生型相当,但却检测不到酶活,说明了GBE的分泌表达和酶的活性形式无关。最后,N-端截断的突变体(Nd1-10)胞外酶活、目的蛋白分泌量都受到了明显的抑制,推测GBE的分泌表达与N-端氨基酸密切相关。(3)探究了GBE与淀粉的作用方式,在最适反应条件下测定其底物特异性,发现GBE更倾向作用于支链淀粉。以直链淀粉为底物,测定GBE的水解作用和转苷作用,反应初期两者同时进行,但以转苷作用为主导。使用高效阴离子交换色谱-脉冲安培检测器(HPAEC-PAD)分析GBE的转苷模式,推测其最小作用链段为聚合度(DP)20,倾向于转移链段DP 7~17。通过基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)测定产物相对分子质量,发现有环状聚合物的生成,说明GBE可以进行环化反应。(4)验证了GBE的活性中心。通过氨基酸序列比对得到GBE催化位点为Asp309、Glu452,同时发现310位丙氨酸在原核生物来源GBE亚族中非常保守。通过定点突变对关键氨基酸310位丙氨酸进行功能研究。将310位丙氨酸分别替换为甘氨酸、天冬氨酸、天冬酰胺、异亮氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺后,比酶活均不足野生型的10%~25%。HPAEC-PAD分析显示突变体没有改变GBE的转苷模式,但使其转苷能力受到限制。动力学分析表明310氨基酸残基影响着GBE的底物特异性。以上结果表明310位丙氨酸与GBE的催化活性、底物特异性密切相关。(5)在确定了GBE的活性中心之后,通过氨基酸序列分析发现349位蛋氨酸在相似性较高的细菌型来源GBE中较保守。通过定点突变在349位上引入羟基类氨基酸残基,相比于野生型GBE,突变体M349T和M349S的比酶活分别增加了24.5%、21.1%。通过GBE改性淀粉应用研究,发现马铃薯淀粉经过突变体M349T、M349S改性后,α-1,6-分支度分别提高了25.5%、16.5%。机理分析结果表明,将蛋氨酸替换成苏氨酸和丝氨酸提高了GBE的比酶活,可能是因为349位氨基酸残基可以与周围氨基酸残基形成了额外的氢键,同时对活性位点环境的疏水性影响较小。
其他文献
2007年10月6日至7日,由中国自然辩证法研究会、陕西省自然辩证法研究会、北京大学与西安建筑科技大学联合主办的第一届全国现象学科技哲学学术会议在西安建筑科技大学隆重召开
山东省果茶技术指导站是山东省果树、茶叶、花卉的综合业务主管部门,拥有与农业部联建的国家级果树无病毒苗木繁育基地、山东省果树良种繁育场。近年来从美、日、澳等国家和
科技的发展使知识成为企业价值的最重要的财富,高新技术企业的迅速崛起是时代的必然,这使得高新技术企业备受关注.本文通过高新技术企业与传统企业的对比,总结出高新技术企业
用DG方法求解奇异摄动问题是近两三年来的热门研究课题。在Shishikin网格下,有些学者的研究工作已经观察到DG解的一致收敛性或超收敛性,但理论上的证明非常困难。本文证明了一
禽流感是禽类感染禽流感病毒后而引起的一种急性、热性、高度接触性传染病。在我国将禽流感列为一类动物疫病。本病可引起养禽业巨大的经济损失,并对人类的健康造成威胁。现
带着一种喜悦和期待的心情,2007的寒假终于来临了。那么,你准备好如何度过新年伊始的这个寒假了吗?兴许你会和朋友或者父母一道去享受郊游时玩耍的快乐,或者你会到公园自由呼
期刊
我国“文革”前十七年的一些长篇小说代表作,歌颂了建国前后各条战线上的人民英雄,洋溢着一种催人向上的革命英雄主义精神。这种英雄主义精神,继承了历史上文学作品中英雄主
遵化市位于河北省东北部燕山南麓长城脚下,总面积为1521km^2,全市共有大小河流37条。境内四面环山,独特的自然环境和地理位置,造成了遵化市降水年际变化悬殊,年内时空分布不
在河南济源王屋山地区(E 112°16′,N35°12′)选择灌丛生境,分别于春季、夏季、秋季释放600枚人工标记的山杏(Prunus armeniaca)种子,旨在了解小型啮齿动物对种子命运影
一、研究背景动脉粥样硬化是血管疾病的主要病因,也是世界范围内主要的致死、致残病因,动脉粥样硬化是一个复杂的病理生理过程,涉及到多个进程,包括内皮损伤、脂质浸润、氧化